Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF6

Efcc1, EF-hand and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efcc1Q9JJF6 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Efcc1Q9JJF6 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Efcc1Q9JJF6 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Efcc1Q9JJF6 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Efcc1Q9JJF6 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Efcc1Q9JJF6 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Efcc1Q9JJF6 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Efcc1Q9JJF6 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Efcc1Q9JJF6 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Efcc1Q9JJF6 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Efcc1Q9JJF6 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Efcc1Q9JJF6 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Efcc1Q9JJF6 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Efcc1Q9JJF6 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Efcc1Q9JJF6 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Efcc1Q9JJF6 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Efcc1Q9JJF6 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Efcc1Q9JJF6 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Efcc1Q9JJF6 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Efcc1Q9JJF6 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Efcc1Q9JJF6 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Efcc1Q9JJF6 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Efcc1Q9JJF6 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Efcc1Q9JJF6 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Efcc1Q9JJF6 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Efcc1Q9JJF6 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Efcc1Q9JJF6 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Efcc1Q9JJF6 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Efcc1Q9JJF6 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Efcc1Q9JJF6 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Efcc1Q9JJF6 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Efcc1Q9JJF6 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Efcc1Q9JJF6 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Efcc1Q9JJF6 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Efcc1Q9JJF6 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Efcc1Q9JJF6 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Efcc1Q9JJF6 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Efcc1Q9JJF6 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Efcc1Q9JJF6 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Efcc1Q9JJF6 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Efcc1Q9JJF6 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Efcc1Q9JJF6 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Efcc1Q9JJF6 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Efcc1Q9JJF6 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Efcc1Q9JJF6 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Efcc1Q9JJF6 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Efcc1Q9JJF6 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Efcc1Q9JJF6 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Efcc1Q9JJF6 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Efcc1Q9JJF6 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Efcc1Q9JJF6 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Efcc1Q9JJF6 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Efcc1Q9JJF6 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Efcc1Q9JJF6 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Efcc1Q9JJF6 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Efcc1Q9JJF6 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Efcc1Q9JJF6 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Efcc1Q9JJF6 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Efcc1Q9JJF6 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Efcc1Q9JJF6 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Efcc1Q9JJF6 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Efcc1Q9JJF6 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Efcc1Q9JJF6 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Efcc1Q9JJF6 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Efcc1Q9JJF6 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Efcc1Q9JJF6 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Efcc1Q9JJF6 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Efcc1Q9JJF6 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Efcc1Q9JJF6 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Efcc1Q9JJF6 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Efcc1Q9JJF6 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Efcc1Q9JJF6 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Efcc1Q9JJF6 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Efcc1Q9JJF6 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Efcc1Q9JJF6 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Efcc1Q9JJF6 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Efcc1Q9JJF6 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Efcc1Q9JJF6 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Efcc1Q9JJF6 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Efcc1Q9JJF6 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Efcc1Q9JJF6 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Efcc1Q9JJF6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Efcc1Q9JJF6 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Efcc1Q9JJF6 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Efcc1Q9JJF6 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Efcc1Q9JJF6 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Efcc1Q9JJF6 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Efcc1Q9JJF6 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Efcc1Q9JJF6 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Efcc1Q9JJF6 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Efcc1Q9JJF6 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Efcc1Q9JJF6 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Efcc1Q9JJF6 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Efcc1Q9JJF6 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Efcc1Q9JJF6 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Efcc1Q9JJF6 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Efcc1Q9JJF6 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Efcc1Q9JJF6 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Efcc1Q9JJF6 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Efcc1Q9JJF6 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms