Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ94

Ssna1, Sjoegren syndrome nuclear autoantigen 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssna1Q9JJ94 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssna1Q9JJ94 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssna1Q9JJ94 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssna1Q9JJ94 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssna1Q9JJ94 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssna1Q9JJ94 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssna1Q9JJ94 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssna1Q9JJ94 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssna1Q9JJ94 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssna1Q9JJ94 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssna1Q9JJ94 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssna1Q9JJ94 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssna1Q9JJ94 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssna1Q9JJ94 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssna1Q9JJ94 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssna1Q9JJ94 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssna1Q9JJ94 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssna1Q9JJ94 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssna1Q9JJ94 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssna1Q9JJ94 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssna1Q9JJ94 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssna1Q9JJ94 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssna1Q9JJ94 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssna1Q9JJ94 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssna1Q9JJ94 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ssna1Q9JJ94 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ssna1Q9JJ94 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ssna1Q9JJ94 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssna1Q9JJ94 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssna1Q9JJ94 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssna1Q9JJ94 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssna1Q9JJ94 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssna1Q9JJ94 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssna1Q9JJ94 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssna1Q9JJ94 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssna1Q9JJ94 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssna1Q9JJ94 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssna1Q9JJ94 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssna1Q9JJ94 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssna1Q9JJ94 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssna1Q9JJ94 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssna1Q9JJ94 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssna1Q9JJ94 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssna1Q9JJ94 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssna1Q9JJ94 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssna1Q9JJ94 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssna1Q9JJ94 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssna1Q9JJ94 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssna1Q9JJ94 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssna1Q9JJ94 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssna1Q9JJ94 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssna1Q9JJ94 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssna1Q9JJ94 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssna1Q9JJ94 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssna1Q9JJ94 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssna1Q9JJ94 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssna1Q9JJ94 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssna1Q9JJ94 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ssna1Q9JJ94 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssna1Q9JJ94 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssna1Q9JJ94 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssna1Q9JJ94 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssna1Q9JJ94 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssna1Q9JJ94 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssna1Q9JJ94 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssna1Q9JJ94 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssna1Q9JJ94 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssna1Q9JJ94 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssna1Q9JJ94 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssna1Q9JJ94 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssna1Q9JJ94 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssna1Q9JJ94 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssna1Q9JJ94 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssna1Q9JJ94 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssna1Q9JJ94 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssna1Q9JJ94 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssna1Q9JJ94 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssna1Q9JJ94 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssna1Q9JJ94 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssna1Q9JJ94 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ssna1Q9JJ94 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssna1Q9JJ94 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssna1Q9JJ94 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssna1Q9JJ94 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssna1Q9JJ94 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssna1Q9JJ94 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssna1Q9JJ94 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssna1Q9JJ94 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssna1Q9JJ94 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssna1Q9JJ94 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssna1Q9JJ94 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssna1Q9JJ94 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ssna1Q9JJ94 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssna1Q9JJ94 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssna1Q9JJ94 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssna1Q9JJ94 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssna1Q9JJ94 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssna1Q9JJ94 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssna1Q9JJ94 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ssna1Q9JJ94 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms