Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESD7

Dysf, Dysferlin, mousemouse

Predictions only

Length 2,090 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DysfQ9ESD7 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
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DysfQ9ESD7 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DysfQ9ESD7 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DysfQ9ESD7 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DysfQ9ESD7 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DysfQ9ESD7 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DysfQ9ESD7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DysfQ9ESD7 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DysfQ9ESD7 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DysfQ9ESD7 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DysfQ9ESD7 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DysfQ9ESD7 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DysfQ9ESD7 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DysfQ9ESD7 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DysfQ9ESD7 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DysfQ9ESD7 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DysfQ9ESD7 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
DysfQ9ESD7 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DysfQ9ESD7 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DysfQ9ESD7 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DysfQ9ESD7 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
DysfQ9ESD7 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DysfQ9ESD7 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DysfQ9ESD7 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DysfQ9ESD7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DysfQ9ESD7 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DysfQ9ESD7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DysfQ9ESD7 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DysfQ9ESD7 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DysfQ9ESD7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DysfQ9ESD7 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DysfQ9ESD7 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DysfQ9ESD7 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DysfQ9ESD7 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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DysfQ9ESD7 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DysfQ9ESD7 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DysfQ9ESD7 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DysfQ9ESD7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DysfQ9ESD7 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DysfQ9ESD7 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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DysfQ9ESD7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DysfQ9ESD7 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DysfQ9ESD7 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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DysfQ9ESD7 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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DysfQ9ESD7 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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DysfQ9ESD7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DysfQ9ESD7 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DysfQ9ESD7 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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DysfQ9ESD7 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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DysfQ9ESD7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DysfQ9ESD7 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DysfQ9ESD7 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DysfQ9ESD7 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DysfQ9ESD7 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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DysfQ9ESD7 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DysfQ9ESD7 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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DysfQ9ESD7 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DysfQ9ESD7 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DysfQ9ESD7 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DysfQ9ESD7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DysfQ9ESD7 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DysfQ9ESD7 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DysfQ9ESD7 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DysfQ9ESD7 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
DysfQ9ESD7 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
DysfQ9ESD7 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DysfQ9ESD7 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DysfQ9ESD7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DysfQ9ESD7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DysfQ9ESD7 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DysfQ9ESD7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DysfQ9ESD7 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DysfQ9ESD7 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DysfQ9ESD7 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DysfQ9ESD7 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DysfQ9ESD7 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DysfQ9ESD7 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DysfQ9ESD7 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
DysfQ9ESD7 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DysfQ9ESD7 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DysfQ9ESD7 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DysfQ9ESD7 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DysfQ9ESD7 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DysfQ9ESD7 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
DysfQ9ESD7 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DysfQ9ESD7 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
DysfQ9ESD7 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms