Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER88

Dap3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dap3Q9ER88 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dap3Q9ER88 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dap3Q9ER88 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Dap3Q9ER88 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Dap3Q9ER88 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Dap3Q9ER88 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Dap3Q9ER88 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Dap3Q9ER88 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dap3Q9ER88 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dap3Q9ER88 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dap3Q9ER88 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dap3Q9ER88 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dap3Q9ER88 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Dap3Q9ER88 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dap3Q9ER88 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dap3Q9ER88 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dap3Q9ER88 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dap3Q9ER88 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dap3Q9ER88 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dap3Q9ER88 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dap3Q9ER88 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dap3Q9ER88 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dap3Q9ER88 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dap3Q9ER88 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dap3Q9ER88 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dap3Q9ER88 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dap3Q9ER88 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dap3Q9ER88 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dap3Q9ER88 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dap3Q9ER88 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dap3Q9ER88 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dap3Q9ER88 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dap3Q9ER88 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dap3Q9ER88 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dap3Q9ER88 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dap3Q9ER88 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dap3Q9ER88 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dap3Q9ER88 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dap3Q9ER88 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dap3Q9ER88 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dap3Q9ER88 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dap3Q9ER88 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Dap3Q9ER88 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Dap3Q9ER88 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dap3Q9ER88 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dap3Q9ER88 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dap3Q9ER88 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dap3Q9ER88 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dap3Q9ER88 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dap3Q9ER88 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dap3Q9ER88 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dap3Q9ER88 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dap3Q9ER88 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dap3Q9ER88 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Dap3Q9ER88 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dap3Q9ER88 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dap3Q9ER88 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dap3Q9ER88 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dap3Q9ER88 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dap3Q9ER88 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dap3Q9ER88 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dap3Q9ER88 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dap3Q9ER88 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dap3Q9ER88 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Dap3Q9ER88 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dap3Q9ER88 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dap3Q9ER88 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dap3Q9ER88 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dap3Q9ER88 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dap3Q9ER88 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dap3Q9ER88 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dap3Q9ER88 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dap3Q9ER88 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dap3Q9ER88 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dap3Q9ER88 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dap3Q9ER88 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dap3Q9ER88 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dap3Q9ER88 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dap3Q9ER88 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dap3Q9ER88 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dap3Q9ER88 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dap3Q9ER88 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dap3Q9ER88 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dap3Q9ER88 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dap3Q9ER88 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dap3Q9ER88 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Dap3Q9ER88 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dap3Q9ER88 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dap3Q9ER88 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dap3Q9ER88 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Dap3Q9ER88 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dap3Q9ER88 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dap3Q9ER88 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Dap3Q9ER88 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dap3Q9ER88 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Dap3Q9ER88 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Dap3Q9ER88 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dap3Q9ER88 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dap3Q9ER88 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Dap3Q9ER88 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms