Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQG9

Col4a3bp, Collagen type IV alpha-3-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3bpQ9EQG9 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Col4a3bpQ9EQG9 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Col4a3bpQ9EQG9 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Col4a3bpQ9EQG9 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Col4a3bpQ9EQG9 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Col4a3bpQ9EQG9 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Col4a3bpQ9EQG9 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Col4a3bpQ9EQG9 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Col4a3bpQ9EQG9 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Col4a3bpQ9EQG9 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Col4a3bpQ9EQG9 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Col4a3bpQ9EQG9 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Col4a3bpQ9EQG9 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Col4a3bpQ9EQG9 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Col4a3bpQ9EQG9 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Col4a3bpQ9EQG9 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Col4a3bpQ9EQG9 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Col4a3bpQ9EQG9 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Col4a3bpQ9EQG9 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Col4a3bpQ9EQG9 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Col4a3bpQ9EQG9 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Col4a3bpQ9EQG9 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Col4a3bpQ9EQG9 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Col4a3bpQ9EQG9 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Col4a3bpQ9EQG9 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Col4a3bpQ9EQG9 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Col4a3bpQ9EQG9 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Col4a3bpQ9EQG9 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Col4a3bpQ9EQG9 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Col4a3bpQ9EQG9 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Col4a3bpQ9EQG9 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Col4a3bpQ9EQG9 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Col4a3bpQ9EQG9 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Col4a3bpQ9EQG9 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Col4a3bpQ9EQG9 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Col4a3bpQ9EQG9 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Col4a3bpQ9EQG9 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Col4a3bpQ9EQG9 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Col4a3bpQ9EQG9 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Col4a3bpQ9EQG9 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Col4a3bpQ9EQG9 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Col4a3bpQ9EQG9 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Col4a3bpQ9EQG9 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Col4a3bpQ9EQG9 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Col4a3bpQ9EQG9 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Col4a3bpQ9EQG9 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Col4a3bpQ9EQG9 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Col4a3bpQ9EQG9 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Col4a3bpQ9EQG9 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Col4a3bpQ9EQG9 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Col4a3bpQ9EQG9 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Col4a3bpQ9EQG9 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Col4a3bpQ9EQG9 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Col4a3bpQ9EQG9 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Col4a3bpQ9EQG9 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Col4a3bpQ9EQG9 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Col4a3bpQ9EQG9 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Col4a3bpQ9EQG9 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Col4a3bpQ9EQG9 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Col4a3bpQ9EQG9 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Col4a3bpQ9EQG9 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Col4a3bpQ9EQG9 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Col4a3bpQ9EQG9 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Col4a3bpQ9EQG9 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Col4a3bpQ9EQG9 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Col4a3bpQ9EQG9 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Col4a3bpQ9EQG9 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Col4a3bpQ9EQG9 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Col4a3bpQ9EQG9 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Col4a3bpQ9EQG9 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Col4a3bpQ9EQG9 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Col4a3bpQ9EQG9 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Col4a3bpQ9EQG9 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Col4a3bpQ9EQG9 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Col4a3bpQ9EQG9 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Col4a3bpQ9EQG9 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Col4a3bpQ9EQG9 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Col4a3bpQ9EQG9 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Col4a3bpQ9EQG9 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Col4a3bpQ9EQG9 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Col4a3bpQ9EQG9 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Col4a3bpQ9EQG9 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Col4a3bpQ9EQG9 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Col4a3bpQ9EQG9 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Col4a3bpQ9EQG9 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Col4a3bpQ9EQG9 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Col4a3bpQ9EQG9 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Col4a3bpQ9EQG9 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Col4a3bpQ9EQG9 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Col4a3bpQ9EQG9 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Col4a3bpQ9EQG9 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Col4a3bpQ9EQG9 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Col4a3bpQ9EQG9 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Col4a3bpQ9EQG9 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Col4a3bpQ9EQG9 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Col4a3bpQ9EQG9 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Col4a3bpQ9EQG9 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Col4a3bpQ9EQG9 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Col4a3bpQ9EQG9 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Col4a3bpQ9EQG9 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms