Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Clstn1Q9EPL2 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Clstn1Q9EPL2 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Clstn1Q9EPL2 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Clstn1Q9EPL2 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Clstn1Q9EPL2 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clstn1Q9EPL2 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clstn1Q9EPL2 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clstn1Q9EPL2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clstn1Q9EPL2 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Clstn1Q9EPL2 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clstn1Q9EPL2 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clstn1Q9EPL2 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clstn1Q9EPL2 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clstn1Q9EPL2 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clstn1Q9EPL2 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clstn1Q9EPL2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Clstn1Q9EPL2 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clstn1Q9EPL2 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clstn1Q9EPL2 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clstn1Q9EPL2 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clstn1Q9EPL2 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clstn1Q9EPL2 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clstn1Q9EPL2 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clstn1Q9EPL2 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clstn1Q9EPL2 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clstn1Q9EPL2 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clstn1Q9EPL2 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clstn1Q9EPL2 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clstn1Q9EPL2 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clstn1Q9EPL2 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clstn1Q9EPL2 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clstn1Q9EPL2 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clstn1Q9EPL2 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clstn1Q9EPL2 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clstn1Q9EPL2 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clstn1Q9EPL2 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clstn1Q9EPL2 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clstn1Q9EPL2 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clstn1Q9EPL2 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clstn1Q9EPL2 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clstn1Q9EPL2 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clstn1Q9EPL2 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clstn1Q9EPL2 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clstn1Q9EPL2 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clstn1Q9EPL2 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clstn1Q9EPL2 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clstn1Q9EPL2 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clstn1Q9EPL2 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clstn1Q9EPL2 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Clstn1Q9EPL2 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clstn1Q9EPL2 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clstn1Q9EPL2 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clstn1Q9EPL2 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clstn1Q9EPL2 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clstn1Q9EPL2 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clstn1Q9EPL2 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clstn1Q9EPL2 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clstn1Q9EPL2 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clstn1Q9EPL2 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clstn1Q9EPL2 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clstn1Q9EPL2 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clstn1Q9EPL2 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clstn1Q9EPL2 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clstn1Q9EPL2 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clstn1Q9EPL2 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clstn1Q9EPL2 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clstn1Q9EPL2 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Clstn1Q9EPL2 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Clstn1Q9EPL2 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Clstn1Q9EPL2 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clstn1Q9EPL2 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clstn1Q9EPL2 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clstn1Q9EPL2 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clstn1Q9EPL2 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clstn1Q9EPL2 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clstn1Q9EPL2 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Clstn1Q9EPL2 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clstn1Q9EPL2 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clstn1Q9EPL2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clstn1Q9EPL2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clstn1Q9EPL2 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clstn1Q9EPL2 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clstn1Q9EPL2 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clstn1Q9EPL2 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clstn1Q9EPL2 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clstn1Q9EPL2 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clstn1Q9EPL2 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clstn1Q9EPL2 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clstn1Q9EPL2 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clstn1Q9EPL2 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clstn1Q9EPL2 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clstn1Q9EPL2 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clstn1Q9EPL2 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clstn1Q9EPL2 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clstn1Q9EPL2 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clstn1Q9EPL2 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clstn1Q9EPL2 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clstn1Q9EPL2 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clstn1Q9EPL2 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms