Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPK2

Rp2, Protein XRP2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rp2Q9EPK2 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Rp2Q9EPK2 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rp2Q9EPK2 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rp2Q9EPK2 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rp2Q9EPK2 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rp2Q9EPK2 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rp2Q9EPK2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rp2Q9EPK2 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rp2Q9EPK2 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rp2Q9EPK2 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rp2Q9EPK2 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rp2Q9EPK2 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rp2Q9EPK2 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rp2Q9EPK2 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rp2Q9EPK2 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rp2Q9EPK2 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rp2Q9EPK2 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rp2Q9EPK2 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rp2Q9EPK2 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rp2Q9EPK2 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rp2Q9EPK2 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rp2Q9EPK2 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rp2Q9EPK2 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rp2Q9EPK2 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rp2Q9EPK2 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rp2Q9EPK2 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rp2Q9EPK2 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rp2Q9EPK2 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Rp2Q9EPK2 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rp2Q9EPK2 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rp2Q9EPK2 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rp2Q9EPK2 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rp2Q9EPK2 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rp2Q9EPK2 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rp2Q9EPK2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rp2Q9EPK2 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rp2Q9EPK2 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rp2Q9EPK2 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rp2Q9EPK2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rp2Q9EPK2 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Rp2Q9EPK2 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rp2Q9EPK2 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Rp2Q9EPK2 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rp2Q9EPK2 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rp2Q9EPK2 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rp2Q9EPK2 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rp2Q9EPK2 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rp2Q9EPK2 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rp2Q9EPK2 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rp2Q9EPK2 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rp2Q9EPK2 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rp2Q9EPK2 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rp2Q9EPK2 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rp2Q9EPK2 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rp2Q9EPK2 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rp2Q9EPK2 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rp2Q9EPK2 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rp2Q9EPK2 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rp2Q9EPK2 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rp2Q9EPK2 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rp2Q9EPK2 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rp2Q9EPK2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rp2Q9EPK2 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rp2Q9EPK2 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rp2Q9EPK2 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rp2Q9EPK2 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rp2Q9EPK2 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rp2Q9EPK2 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rp2Q9EPK2 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rp2Q9EPK2 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Rp2Q9EPK2 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rp2Q9EPK2 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rp2Q9EPK2 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rp2Q9EPK2 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rp2Q9EPK2 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rp2Q9EPK2 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rp2Q9EPK2 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rp2Q9EPK2 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rp2Q9EPK2 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rp2Q9EPK2 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rp2Q9EPK2 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rp2Q9EPK2 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rp2Q9EPK2 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rp2Q9EPK2 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rp2Q9EPK2 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rp2Q9EPK2 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rp2Q9EPK2 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rp2Q9EPK2 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rp2Q9EPK2 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rp2Q9EPK2 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rp2Q9EPK2 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rp2Q9EPK2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rp2Q9EPK2 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rp2Q9EPK2 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Rp2Q9EPK2 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rp2Q9EPK2 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rp2Q9EPK2 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rp2Q9EPK2 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rp2Q9EPK2 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rp2Q9EPK2 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms