Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCT6

Bap18, Chromatin complexes subunit BAP18, mousemouse

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bap18Q9DCT6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bap18Q9DCT6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Bap18Q9DCT6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bap18Q9DCT6 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bap18Q9DCT6 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bap18Q9DCT6 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bap18Q9DCT6 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bap18Q9DCT6 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bap18Q9DCT6 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bap18Q9DCT6 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bap18Q9DCT6 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bap18Q9DCT6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bap18Q9DCT6 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bap18Q9DCT6 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bap18Q9DCT6 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bap18Q9DCT6 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bap18Q9DCT6 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bap18Q9DCT6 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bap18Q9DCT6 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bap18Q9DCT6 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bap18Q9DCT6 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bap18Q9DCT6 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bap18Q9DCT6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bap18Q9DCT6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bap18Q9DCT6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Bap18Q9DCT6 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bap18Q9DCT6 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bap18Q9DCT6 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bap18Q9DCT6 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bap18Q9DCT6 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bap18Q9DCT6 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bap18Q9DCT6 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bap18Q9DCT6 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bap18Q9DCT6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bap18Q9DCT6 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bap18Q9DCT6 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bap18Q9DCT6 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bap18Q9DCT6 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bap18Q9DCT6 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bap18Q9DCT6 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bap18Q9DCT6 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bap18Q9DCT6 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bap18Q9DCT6 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bap18Q9DCT6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bap18Q9DCT6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bap18Q9DCT6 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bap18Q9DCT6 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bap18Q9DCT6 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bap18Q9DCT6 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bap18Q9DCT6 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bap18Q9DCT6 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bap18Q9DCT6 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bap18Q9DCT6 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bap18Q9DCT6 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bap18Q9DCT6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Bap18Q9DCT6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bap18Q9DCT6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bap18Q9DCT6 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bap18Q9DCT6 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bap18Q9DCT6 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bap18Q9DCT6 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bap18Q9DCT6 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bap18Q9DCT6 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bap18Q9DCT6 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bap18Q9DCT6 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bap18Q9DCT6 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Bap18Q9DCT6 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bap18Q9DCT6 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bap18Q9DCT6 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bap18Q9DCT6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bap18Q9DCT6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bap18Q9DCT6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bap18Q9DCT6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bap18Q9DCT6 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bap18Q9DCT6 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bap18Q9DCT6 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bap18Q9DCT6 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bap18Q9DCT6 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bap18Q9DCT6 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bap18Q9DCT6 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bap18Q9DCT6 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bap18Q9DCT6 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bap18Q9DCT6 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bap18Q9DCT6 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bap18Q9DCT6 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bap18Q9DCT6 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bap18Q9DCT6 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bap18Q9DCT6 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bap18Q9DCT6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bap18Q9DCT6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bap18Q9DCT6 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bap18Q9DCT6 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bap18Q9DCT6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bap18Q9DCT6 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bap18Q9DCT6 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bap18Q9DCT6 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Bap18Q9DCT6 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Bap18Q9DCT6 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Bap18Q9DCT6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bap18Q9DCT6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms