Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCT2

Ndufs3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufs3Q9DCT2 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ndufs3Q9DCT2 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ndufs3Q9DCT2 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ndufs3Q9DCT2 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ndufs3Q9DCT2 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ndufs3Q9DCT2 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ndufs3Q9DCT2 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ndufs3Q9DCT2 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ndufs3Q9DCT2 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ndufs3Q9DCT2 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ndufs3Q9DCT2 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ndufs3Q9DCT2 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ndufs3Q9DCT2 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ndufs3Q9DCT2 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ndufs3Q9DCT2 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ndufs3Q9DCT2 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ndufs3Q9DCT2 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ndufs3Q9DCT2 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ndufs3Q9DCT2 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ndufs3Q9DCT2 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ndufs3Q9DCT2 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ndufs3Q9DCT2 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ndufs3Q9DCT2 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ndufs3Q9DCT2 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ndufs3Q9DCT2 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ndufs3Q9DCT2 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ndufs3Q9DCT2 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ndufs3Q9DCT2 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ndufs3Q9DCT2 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ndufs3Q9DCT2 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ndufs3Q9DCT2 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ndufs3Q9DCT2 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ndufs3Q9DCT2 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ndufs3Q9DCT2 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ndufs3Q9DCT2 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ndufs3Q9DCT2 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ndufs3Q9DCT2 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ndufs3Q9DCT2 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ndufs3Q9DCT2 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ndufs3Q9DCT2 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ndufs3Q9DCT2 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ndufs3Q9DCT2 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ndufs3Q9DCT2 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ndufs3Q9DCT2 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ndufs3Q9DCT2 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ndufs3Q9DCT2 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ndufs3Q9DCT2 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ndufs3Q9DCT2 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ndufs3Q9DCT2 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ndufs3Q9DCT2 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ndufs3Q9DCT2 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ndufs3Q9DCT2 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ndufs3Q9DCT2 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ndufs3Q9DCT2 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ndufs3Q9DCT2 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ndufs3Q9DCT2 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ndufs3Q9DCT2 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ndufs3Q9DCT2 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ndufs3Q9DCT2 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ndufs3Q9DCT2 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ndufs3Q9DCT2 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ndufs3Q9DCT2 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ndufs3Q9DCT2 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ndufs3Q9DCT2 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ndufs3Q9DCT2 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ndufs3Q9DCT2 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ndufs3Q9DCT2 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ndufs3Q9DCT2 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ndufs3Q9DCT2 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ndufs3Q9DCT2 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ndufs3Q9DCT2 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ndufs3Q9DCT2 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ndufs3Q9DCT2 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ndufs3Q9DCT2 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ndufs3Q9DCT2 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ndufs3Q9DCT2 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ndufs3Q9DCT2 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ndufs3Q9DCT2 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ndufs3Q9DCT2 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ndufs3Q9DCT2 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ndufs3Q9DCT2 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ndufs3Q9DCT2 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ndufs3Q9DCT2 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ndufs3Q9DCT2 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ndufs3Q9DCT2 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ndufs3Q9DCT2 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ndufs3Q9DCT2 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ndufs3Q9DCT2 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ndufs3Q9DCT2 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ndufs3Q9DCT2 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ndufs3Q9DCT2 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ndufs3Q9DCT2 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ndufs3Q9DCT2 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ndufs3Q9DCT2 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ndufs3Q9DCT2 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ndufs3Q9DCT2 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ndufs3Q9DCT2 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ndufs3Q9DCT2 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ndufs3Q9DCT2 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ndufs3Q9DCT2 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms