Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Med27Q9DB40 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Med27Q9DB40 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Med27Q9DB40 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Med27Q9DB40 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Med27Q9DB40 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Med27Q9DB40 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Med27Q9DB40 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Med27Q9DB40 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Med27Q9DB40 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Med27Q9DB40 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Med27Q9DB40 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Med27Q9DB40 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Med27Q9DB40 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Med27Q9DB40 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Med27Q9DB40 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Med27Q9DB40 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Med27Q9DB40 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Med27Q9DB40 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Med27Q9DB40 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Med27Q9DB40 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Med27Q9DB40 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Med27Q9DB40 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Med27Q9DB40 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Med27Q9DB40 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Med27Q9DB40 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Med27Q9DB40 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Med27Q9DB40 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Med27Q9DB40 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Med27Q9DB40 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Med27Q9DB40 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Med27Q9DB40 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Med27Q9DB40 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Med27Q9DB40 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Med27Q9DB40 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Med27Q9DB40 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Med27Q9DB40 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Med27Q9DB40 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Med27Q9DB40 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Med27Q9DB40 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Med27Q9DB40 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Med27Q9DB40 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Med27Q9DB40 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Med27Q9DB40 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Med27Q9DB40 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Med27Q9DB40 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Med27Q9DB40 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Med27Q9DB40 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Med27Q9DB40 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Med27Q9DB40 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Med27Q9DB40 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Med27Q9DB40 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Med27Q9DB40 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Med27Q9DB40 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Med27Q9DB40 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Med27Q9DB40 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Med27Q9DB40 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Med27Q9DB40 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Med27Q9DB40 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Med27Q9DB40 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Med27Q9DB40 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Med27Q9DB40 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Med27Q9DB40 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Med27Q9DB40 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Med27Q9DB40 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Med27Q9DB40 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Med27Q9DB40 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Med27Q9DB40 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Med27Q9DB40 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Med27Q9DB40 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Med27Q9DB40 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Med27Q9DB40 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Med27Q9DB40 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Med27Q9DB40 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Med27Q9DB40 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Med27Q9DB40 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Med27Q9DB40 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Med27Q9DB40 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Med27Q9DB40 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Med27Q9DB40 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Med27Q9DB40 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Med27Q9DB40 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Med27Q9DB40 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Med27Q9DB40 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Med27Q9DB40 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Med27Q9DB40 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Med27Q9DB40 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Med27Q9DB40 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Med27Q9DB40 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Med27Q9DB40 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Med27Q9DB40 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Med27Q9DB40 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Med27Q9DB40 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Med27Q9DB40 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Med27Q9DB40 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Med27Q9DB40 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Med27Q9DB40 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Med27Q9DB40 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Med27Q9DB40 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Med27Q9DB40 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms