Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAC0

Cmtm2b, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm2bQ9DAC0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cmtm2bQ9DAC0 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cmtm2bQ9DAC0 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cmtm2bQ9DAC0 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cmtm2bQ9DAC0 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cmtm2bQ9DAC0 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cmtm2bQ9DAC0 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cmtm2bQ9DAC0 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cmtm2bQ9DAC0 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cmtm2bQ9DAC0 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cmtm2bQ9DAC0 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cmtm2bQ9DAC0 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cmtm2bQ9DAC0 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cmtm2bQ9DAC0 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cmtm2bQ9DAC0 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cmtm2bQ9DAC0 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cmtm2bQ9DAC0 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cmtm2bQ9DAC0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cmtm2bQ9DAC0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cmtm2bQ9DAC0 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cmtm2bQ9DAC0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Cmtm2bQ9DAC0 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cmtm2bQ9DAC0 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cmtm2bQ9DAC0 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cmtm2bQ9DAC0 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cmtm2bQ9DAC0 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cmtm2bQ9DAC0 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cmtm2bQ9DAC0 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cmtm2bQ9DAC0 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cmtm2bQ9DAC0 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cmtm2bQ9DAC0 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cmtm2bQ9DAC0 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cmtm2bQ9DAC0 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cmtm2bQ9DAC0 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cmtm2bQ9DAC0 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Cmtm2bQ9DAC0 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cmtm2bQ9DAC0 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cmtm2bQ9DAC0 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cmtm2bQ9DAC0 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cmtm2bQ9DAC0 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cmtm2bQ9DAC0 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cmtm2bQ9DAC0 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cmtm2bQ9DAC0 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cmtm2bQ9DAC0 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cmtm2bQ9DAC0 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cmtm2bQ9DAC0 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cmtm2bQ9DAC0 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cmtm2bQ9DAC0 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cmtm2bQ9DAC0 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Cmtm2bQ9DAC0 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cmtm2bQ9DAC0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cmtm2bQ9DAC0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cmtm2bQ9DAC0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cmtm2bQ9DAC0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cmtm2bQ9DAC0 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cmtm2bQ9DAC0 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cmtm2bQ9DAC0 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cmtm2bQ9DAC0 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cmtm2bQ9DAC0 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cmtm2bQ9DAC0 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cmtm2bQ9DAC0 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cmtm2bQ9DAC0 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cmtm2bQ9DAC0 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.05■□□□□ -0
Cmtm2bQ9DAC0 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cmtm2bQ9DAC0 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cmtm2bQ9DAC0 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cmtm2bQ9DAC0 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cmtm2bQ9DAC0 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cmtm2bQ9DAC0 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cmtm2bQ9DAC0 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cmtm2bQ9DAC0 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cmtm2bQ9DAC0 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Cmtm2bQ9DAC0 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cmtm2bQ9DAC0 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cmtm2bQ9DAC0 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cmtm2bQ9DAC0 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cmtm2bQ9DAC0 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cmtm2bQ9DAC0 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cmtm2bQ9DAC0 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cmtm2bQ9DAC0 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cmtm2bQ9DAC0 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cmtm2bQ9DAC0 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cmtm2bQ9DAC0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cmtm2bQ9DAC0 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cmtm2bQ9DAC0 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cmtm2bQ9DAC0 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cmtm2bQ9DAC0 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cmtm2bQ9DAC0 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cmtm2bQ9DAC0 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cmtm2bQ9DAC0 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cmtm2bQ9DAC0 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cmtm2bQ9DAC0 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cmtm2bQ9DAC0 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cmtm2bQ9DAC0 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cmtm2bQ9DAC0 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cmtm2bQ9DAC0 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cmtm2bQ9DAC0 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cmtm2bQ9DAC0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cmtm2bQ9DAC0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cmtm2bQ9DAC0 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms