Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA37

Samd8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd8Q9DA37 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Samd8Q9DA37 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Samd8Q9DA37 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Samd8Q9DA37 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Samd8Q9DA37 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Samd8Q9DA37 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Samd8Q9DA37 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Samd8Q9DA37 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Samd8Q9DA37 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Samd8Q9DA37 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Samd8Q9DA37 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Samd8Q9DA37 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Samd8Q9DA37 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Samd8Q9DA37 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Samd8Q9DA37 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Samd8Q9DA37 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Samd8Q9DA37 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Samd8Q9DA37 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Samd8Q9DA37 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Samd8Q9DA37 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Samd8Q9DA37 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Samd8Q9DA37 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Samd8Q9DA37 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Samd8Q9DA37 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Samd8Q9DA37 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Samd8Q9DA37 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Samd8Q9DA37 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Samd8Q9DA37 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Samd8Q9DA37 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Samd8Q9DA37 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Samd8Q9DA37 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Samd8Q9DA37 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Samd8Q9DA37 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Samd8Q9DA37 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Samd8Q9DA37 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Samd8Q9DA37 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Samd8Q9DA37 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Samd8Q9DA37 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Samd8Q9DA37 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Samd8Q9DA37 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Samd8Q9DA37 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Samd8Q9DA37 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Samd8Q9DA37 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Samd8Q9DA37 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Samd8Q9DA37 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Samd8Q9DA37 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Samd8Q9DA37 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Samd8Q9DA37 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Samd8Q9DA37 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Samd8Q9DA37 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Samd8Q9DA37 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Samd8Q9DA37 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Samd8Q9DA37 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Samd8Q9DA37 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Samd8Q9DA37 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Samd8Q9DA37 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Samd8Q9DA37 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Samd8Q9DA37 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Samd8Q9DA37 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Samd8Q9DA37 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Samd8Q9DA37 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Samd8Q9DA37 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Samd8Q9DA37 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Samd8Q9DA37 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Samd8Q9DA37 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Samd8Q9DA37 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Samd8Q9DA37 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Samd8Q9DA37 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Samd8Q9DA37 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Samd8Q9DA37 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Samd8Q9DA37 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Samd8Q9DA37 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Samd8Q9DA37 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Samd8Q9DA37 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Samd8Q9DA37 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Samd8Q9DA37 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Samd8Q9DA37 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Samd8Q9DA37 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Samd8Q9DA37 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Samd8Q9DA37 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Samd8Q9DA37 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Samd8Q9DA37 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Samd8Q9DA37 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Samd8Q9DA37 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Samd8Q9DA37 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Samd8Q9DA37 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Samd8Q9DA37 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Samd8Q9DA37 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Samd8Q9DA37 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Samd8Q9DA37 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Samd8Q9DA37 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Samd8Q9DA37 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Samd8Q9DA37 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Samd8Q9DA37 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Samd8Q9DA37 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Samd8Q9DA37 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Samd8Q9DA37 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Samd8Q9DA37 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Samd8Q9DA37 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Samd8Q9DA37 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms