Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8E6

Rpl4, 60S ribosomal protein L4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl4Q9D8E6 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rpl4Q9D8E6 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rpl4Q9D8E6 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rpl4Q9D8E6 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rpl4Q9D8E6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rpl4Q9D8E6 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rpl4Q9D8E6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rpl4Q9D8E6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rpl4Q9D8E6 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rpl4Q9D8E6 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rpl4Q9D8E6 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rpl4Q9D8E6 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rpl4Q9D8E6 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rpl4Q9D8E6 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rpl4Q9D8E6 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rpl4Q9D8E6 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Rpl4Q9D8E6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rpl4Q9D8E6 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rpl4Q9D8E6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rpl4Q9D8E6 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rpl4Q9D8E6 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rpl4Q9D8E6 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rpl4Q9D8E6 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rpl4Q9D8E6 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rpl4Q9D8E6 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rpl4Q9D8E6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rpl4Q9D8E6 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rpl4Q9D8E6 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rpl4Q9D8E6 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rpl4Q9D8E6 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rpl4Q9D8E6 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rpl4Q9D8E6 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rpl4Q9D8E6 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Rpl4Q9D8E6 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rpl4Q9D8E6 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rpl4Q9D8E6 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Rpl4Q9D8E6 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rpl4Q9D8E6 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rpl4Q9D8E6 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rpl4Q9D8E6 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rpl4Q9D8E6 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rpl4Q9D8E6 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Rpl4Q9D8E6 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rpl4Q9D8E6 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rpl4Q9D8E6 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rpl4Q9D8E6 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rpl4Q9D8E6 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rpl4Q9D8E6 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rpl4Q9D8E6 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rpl4Q9D8E6 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rpl4Q9D8E6 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rpl4Q9D8E6 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rpl4Q9D8E6 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Rpl4Q9D8E6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rpl4Q9D8E6 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rpl4Q9D8E6 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rpl4Q9D8E6 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rpl4Q9D8E6 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rpl4Q9D8E6 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rpl4Q9D8E6 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rpl4Q9D8E6 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Rpl4Q9D8E6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rpl4Q9D8E6 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rpl4Q9D8E6 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rpl4Q9D8E6 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rpl4Q9D8E6 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rpl4Q9D8E6 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rpl4Q9D8E6 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rpl4Q9D8E6 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Rpl4Q9D8E6 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Rpl4Q9D8E6 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Rpl4Q9D8E6 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rpl4Q9D8E6 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rpl4Q9D8E6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Rpl4Q9D8E6 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Rpl4Q9D8E6 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Rpl4Q9D8E6 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Rpl4Q9D8E6 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rpl4Q9D8E6 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rpl4Q9D8E6 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rpl4Q9D8E6 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rpl4Q9D8E6 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rpl4Q9D8E6 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rpl4Q9D8E6 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rpl4Q9D8E6 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rpl4Q9D8E6 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rpl4Q9D8E6 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rpl4Q9D8E6 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rpl4Q9D8E6 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rpl4Q9D8E6 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rpl4Q9D8E6 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rpl4Q9D8E6 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Rpl4Q9D8E6 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rpl4Q9D8E6 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rpl4Q9D8E6 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rpl4Q9D8E6 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rpl4Q9D8E6 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rpl4Q9D8E6 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rpl4Q9D8E6 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rpl4Q9D8E6 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms