Protein–RNA interactions for Protein: Q9D869

Chp2, Calcineurin B homologous protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chp2Q9D869 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chp2Q9D869 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chp2Q9D869 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chp2Q9D869 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chp2Q9D869 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chp2Q9D869 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chp2Q9D869 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chp2Q9D869 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chp2Q9D869 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Chp2Q9D869 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chp2Q9D869 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chp2Q9D869 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chp2Q9D869 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chp2Q9D869 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chp2Q9D869 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chp2Q9D869 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Chp2Q9D869 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Chp2Q9D869 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chp2Q9D869 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Chp2Q9D869 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chp2Q9D869 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Chp2Q9D869 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Chp2Q9D869 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chp2Q9D869 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chp2Q9D869 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chp2Q9D869 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Chp2Q9D869 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chp2Q9D869 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chp2Q9D869 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chp2Q9D869 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chp2Q9D869 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chp2Q9D869 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chp2Q9D869 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chp2Q9D869 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chp2Q9D869 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chp2Q9D869 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Chp2Q9D869 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chp2Q9D869 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chp2Q9D869 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Chp2Q9D869 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chp2Q9D869 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chp2Q9D869 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chp2Q9D869 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chp2Q9D869 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chp2Q9D869 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Chp2Q9D869 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Chp2Q9D869 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Chp2Q9D869 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Chp2Q9D869 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Chp2Q9D869 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Chp2Q9D869 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Chp2Q9D869 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Chp2Q9D869 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Chp2Q9D869 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Chp2Q9D869 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Chp2Q9D869 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Chp2Q9D869 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Chp2Q9D869 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Chp2Q9D869 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Chp2Q9D869 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Chp2Q9D869 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Chp2Q9D869 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Chp2Q9D869 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Chp2Q9D869 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Chp2Q9D869 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Chp2Q9D869 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Chp2Q9D869 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Chp2Q9D869 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Chp2Q9D869 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chp2Q9D869 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chp2Q9D869 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chp2Q9D869 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chp2Q9D869 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chp2Q9D869 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chp2Q9D869 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chp2Q9D869 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chp2Q9D869 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chp2Q9D869 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chp2Q9D869 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chp2Q9D869 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Chp2Q9D869 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Chp2Q9D869 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Chp2Q9D869 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Chp2Q9D869 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Chp2Q9D869 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Chp2Q9D869 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Chp2Q9D869 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Chp2Q9D869 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Chp2Q9D869 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Chp2Q9D869 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Chp2Q9D869 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Chp2Q9D869 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Chp2Q9D869 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Chp2Q9D869 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Chp2Q9D869 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Chp2Q9D869 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chp2Q9D869 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chp2Q9D869 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chp2Q9D869 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Chp2Q9D869 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms