Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7W4

Tspan17, Tetraspanin-17, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan17Q9D7W4 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tspan17Q9D7W4 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tspan17Q9D7W4 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tspan17Q9D7W4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tspan17Q9D7W4 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tspan17Q9D7W4 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tspan17Q9D7W4 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tspan17Q9D7W4 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tspan17Q9D7W4 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tspan17Q9D7W4 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tspan17Q9D7W4 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tspan17Q9D7W4 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tspan17Q9D7W4 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tspan17Q9D7W4 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tspan17Q9D7W4 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tspan17Q9D7W4 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tspan17Q9D7W4 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tspan17Q9D7W4 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tspan17Q9D7W4 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tspan17Q9D7W4 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tspan17Q9D7W4 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tspan17Q9D7W4 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tspan17Q9D7W4 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tspan17Q9D7W4 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tspan17Q9D7W4 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tspan17Q9D7W4 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tspan17Q9D7W4 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tspan17Q9D7W4 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tspan17Q9D7W4 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tspan17Q9D7W4 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tspan17Q9D7W4 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tspan17Q9D7W4 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tspan17Q9D7W4 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tspan17Q9D7W4 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tspan17Q9D7W4 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tspan17Q9D7W4 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tspan17Q9D7W4 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tspan17Q9D7W4 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tspan17Q9D7W4 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tspan17Q9D7W4 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tspan17Q9D7W4 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tspan17Q9D7W4 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tspan17Q9D7W4 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tspan17Q9D7W4 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tspan17Q9D7W4 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tspan17Q9D7W4 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tspan17Q9D7W4 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tspan17Q9D7W4 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tspan17Q9D7W4 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tspan17Q9D7W4 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tspan17Q9D7W4 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tspan17Q9D7W4 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tspan17Q9D7W4 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tspan17Q9D7W4 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tspan17Q9D7W4 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tspan17Q9D7W4 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tspan17Q9D7W4 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tspan17Q9D7W4 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tspan17Q9D7W4 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Tspan17Q9D7W4 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tspan17Q9D7W4 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tspan17Q9D7W4 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tspan17Q9D7W4 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tspan17Q9D7W4 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tspan17Q9D7W4 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tspan17Q9D7W4 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Tspan17Q9D7W4 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tspan17Q9D7W4 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tspan17Q9D7W4 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tspan17Q9D7W4 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tspan17Q9D7W4 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tspan17Q9D7W4 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tspan17Q9D7W4 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tspan17Q9D7W4 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tspan17Q9D7W4 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Tspan17Q9D7W4 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tspan17Q9D7W4 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tspan17Q9D7W4 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tspan17Q9D7W4 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tspan17Q9D7W4 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tspan17Q9D7W4 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tspan17Q9D7W4 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Tspan17Q9D7W4 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tspan17Q9D7W4 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tspan17Q9D7W4 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tspan17Q9D7W4 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tspan17Q9D7W4 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tspan17Q9D7W4 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tspan17Q9D7W4 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tspan17Q9D7W4 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tspan17Q9D7W4 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tspan17Q9D7W4 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Tspan17Q9D7W4 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Tspan17Q9D7W4 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tspan17Q9D7W4 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tspan17Q9D7W4 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tspan17Q9D7W4 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tspan17Q9D7W4 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tspan17Q9D7W4 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tspan17Q9D7W4 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms