Protein–RNA interactions for Protein: Q9D665

Sdr42e1, Short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 1, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr42e1Q9D665 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sdr42e1Q9D665 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sdr42e1Q9D665 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sdr42e1Q9D665 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sdr42e1Q9D665 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sdr42e1Q9D665 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sdr42e1Q9D665 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sdr42e1Q9D665 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sdr42e1Q9D665 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sdr42e1Q9D665 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sdr42e1Q9D665 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sdr42e1Q9D665 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sdr42e1Q9D665 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sdr42e1Q9D665 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Sdr42e1Q9D665 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sdr42e1Q9D665 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sdr42e1Q9D665 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sdr42e1Q9D665 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sdr42e1Q9D665 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sdr42e1Q9D665 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Sdr42e1Q9D665 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sdr42e1Q9D665 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sdr42e1Q9D665 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sdr42e1Q9D665 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sdr42e1Q9D665 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sdr42e1Q9D665 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sdr42e1Q9D665 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sdr42e1Q9D665 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sdr42e1Q9D665 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sdr42e1Q9D665 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sdr42e1Q9D665 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sdr42e1Q9D665 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sdr42e1Q9D665 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sdr42e1Q9D665 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sdr42e1Q9D665 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sdr42e1Q9D665 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sdr42e1Q9D665 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sdr42e1Q9D665 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sdr42e1Q9D665 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sdr42e1Q9D665 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Sdr42e1Q9D665 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sdr42e1Q9D665 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Sdr42e1Q9D665 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Sdr42e1Q9D665 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Sdr42e1Q9D665 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sdr42e1Q9D665 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sdr42e1Q9D665 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sdr42e1Q9D665 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sdr42e1Q9D665 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sdr42e1Q9D665 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sdr42e1Q9D665 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sdr42e1Q9D665 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sdr42e1Q9D665 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sdr42e1Q9D665 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sdr42e1Q9D665 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sdr42e1Q9D665 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sdr42e1Q9D665 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sdr42e1Q9D665 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sdr42e1Q9D665 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sdr42e1Q9D665 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sdr42e1Q9D665 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sdr42e1Q9D665 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sdr42e1Q9D665 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sdr42e1Q9D665 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sdr42e1Q9D665 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sdr42e1Q9D665 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sdr42e1Q9D665 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sdr42e1Q9D665 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sdr42e1Q9D665 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sdr42e1Q9D665 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sdr42e1Q9D665 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sdr42e1Q9D665 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sdr42e1Q9D665 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sdr42e1Q9D665 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sdr42e1Q9D665 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sdr42e1Q9D665 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sdr42e1Q9D665 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sdr42e1Q9D665 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sdr42e1Q9D665 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sdr42e1Q9D665 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sdr42e1Q9D665 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sdr42e1Q9D665 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sdr42e1Q9D665 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sdr42e1Q9D665 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sdr42e1Q9D665 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sdr42e1Q9D665 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sdr42e1Q9D665 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sdr42e1Q9D665 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sdr42e1Q9D665 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sdr42e1Q9D665 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sdr42e1Q9D665 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sdr42e1Q9D665 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sdr42e1Q9D665 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sdr42e1Q9D665 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sdr42e1Q9D665 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sdr42e1Q9D665 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sdr42e1Q9D665 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sdr42e1Q9D665 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sdr42e1Q9D665 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sdr42e1Q9D665 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.4 ms