Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PudpQ9D5U5 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PudpQ9D5U5 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PudpQ9D5U5 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PudpQ9D5U5 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PudpQ9D5U5 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PudpQ9D5U5 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PudpQ9D5U5 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PudpQ9D5U5 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PudpQ9D5U5 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PudpQ9D5U5 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PudpQ9D5U5 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PudpQ9D5U5 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PudpQ9D5U5 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PudpQ9D5U5 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PudpQ9D5U5 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PudpQ9D5U5 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PudpQ9D5U5 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PudpQ9D5U5 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PudpQ9D5U5 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PudpQ9D5U5 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PudpQ9D5U5 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PudpQ9D5U5 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PudpQ9D5U5 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PudpQ9D5U5 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PudpQ9D5U5 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PudpQ9D5U5 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PudpQ9D5U5 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PudpQ9D5U5 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PudpQ9D5U5 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PudpQ9D5U5 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PudpQ9D5U5 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PudpQ9D5U5 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PudpQ9D5U5 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PudpQ9D5U5 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PudpQ9D5U5 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PudpQ9D5U5 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PudpQ9D5U5 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PudpQ9D5U5 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PudpQ9D5U5 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PudpQ9D5U5 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PudpQ9D5U5 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PudpQ9D5U5 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PudpQ9D5U5 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PudpQ9D5U5 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PudpQ9D5U5 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PudpQ9D5U5 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PudpQ9D5U5 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PudpQ9D5U5 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PudpQ9D5U5 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PudpQ9D5U5 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PudpQ9D5U5 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PudpQ9D5U5 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PudpQ9D5U5 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PudpQ9D5U5 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PudpQ9D5U5 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PudpQ9D5U5 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PudpQ9D5U5 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PudpQ9D5U5 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PudpQ9D5U5 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PudpQ9D5U5 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PudpQ9D5U5 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PudpQ9D5U5 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PudpQ9D5U5 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PudpQ9D5U5 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PudpQ9D5U5 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PudpQ9D5U5 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PudpQ9D5U5 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PudpQ9D5U5 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PudpQ9D5U5 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PudpQ9D5U5 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PudpQ9D5U5 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PudpQ9D5U5 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PudpQ9D5U5 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PudpQ9D5U5 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PudpQ9D5U5 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PudpQ9D5U5 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PudpQ9D5U5 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PudpQ9D5U5 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PudpQ9D5U5 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PudpQ9D5U5 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PudpQ9D5U5 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PudpQ9D5U5 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PudpQ9D5U5 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PudpQ9D5U5 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PudpQ9D5U5 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PudpQ9D5U5 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PudpQ9D5U5 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PudpQ9D5U5 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PudpQ9D5U5 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PudpQ9D5U5 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PudpQ9D5U5 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PudpQ9D5U5 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PudpQ9D5U5 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PudpQ9D5U5 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PudpQ9D5U5 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PudpQ9D5U5 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PudpQ9D5U5 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PudpQ9D5U5 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PudpQ9D5U5 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms