Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5L7

Spsb1, SPRY domain-containing SOCS box protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spsb1Q9D5L7 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spsb1Q9D5L7 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spsb1Q9D5L7 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spsb1Q9D5L7 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spsb1Q9D5L7 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spsb1Q9D5L7 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spsb1Q9D5L7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spsb1Q9D5L7 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spsb1Q9D5L7 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spsb1Q9D5L7 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spsb1Q9D5L7 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spsb1Q9D5L7 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spsb1Q9D5L7 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spsb1Q9D5L7 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spsb1Q9D5L7 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spsb1Q9D5L7 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spsb1Q9D5L7 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Spsb1Q9D5L7 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spsb1Q9D5L7 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spsb1Q9D5L7 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spsb1Q9D5L7 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Spsb1Q9D5L7 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spsb1Q9D5L7 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spsb1Q9D5L7 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spsb1Q9D5L7 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spsb1Q9D5L7 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spsb1Q9D5L7 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spsb1Q9D5L7 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spsb1Q9D5L7 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Spsb1Q9D5L7 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Spsb1Q9D5L7 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Spsb1Q9D5L7 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spsb1Q9D5L7 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spsb1Q9D5L7 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spsb1Q9D5L7 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spsb1Q9D5L7 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spsb1Q9D5L7 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spsb1Q9D5L7 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spsb1Q9D5L7 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spsb1Q9D5L7 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spsb1Q9D5L7 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spsb1Q9D5L7 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spsb1Q9D5L7 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Spsb1Q9D5L7 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spsb1Q9D5L7 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spsb1Q9D5L7 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spsb1Q9D5L7 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spsb1Q9D5L7 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spsb1Q9D5L7 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spsb1Q9D5L7 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spsb1Q9D5L7 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spsb1Q9D5L7 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spsb1Q9D5L7 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spsb1Q9D5L7 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spsb1Q9D5L7 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spsb1Q9D5L7 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spsb1Q9D5L7 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spsb1Q9D5L7 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spsb1Q9D5L7 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spsb1Q9D5L7 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spsb1Q9D5L7 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spsb1Q9D5L7 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spsb1Q9D5L7 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spsb1Q9D5L7 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spsb1Q9D5L7 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Spsb1Q9D5L7 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spsb1Q9D5L7 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spsb1Q9D5L7 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spsb1Q9D5L7 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spsb1Q9D5L7 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spsb1Q9D5L7 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spsb1Q9D5L7 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spsb1Q9D5L7 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spsb1Q9D5L7 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spsb1Q9D5L7 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spsb1Q9D5L7 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spsb1Q9D5L7 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spsb1Q9D5L7 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spsb1Q9D5L7 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spsb1Q9D5L7 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spsb1Q9D5L7 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spsb1Q9D5L7 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spsb1Q9D5L7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spsb1Q9D5L7 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spsb1Q9D5L7 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spsb1Q9D5L7 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spsb1Q9D5L7 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spsb1Q9D5L7 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spsb1Q9D5L7 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spsb1Q9D5L7 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spsb1Q9D5L7 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spsb1Q9D5L7 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spsb1Q9D5L7 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spsb1Q9D5L7 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spsb1Q9D5L7 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spsb1Q9D5L7 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spsb1Q9D5L7 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spsb1Q9D5L7 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spsb1Q9D5L7 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spsb1Q9D5L7 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms