Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc130Q9D516 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc130Q9D516 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc130Q9D516 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc130Q9D516 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc130Q9D516 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc130Q9D516 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc130Q9D516 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc130Q9D516 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc130Q9D516 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc130Q9D516 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc130Q9D516 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc130Q9D516 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc130Q9D516 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc130Q9D516 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc130Q9D516 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc130Q9D516 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc130Q9D516 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc130Q9D516 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc130Q9D516 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc130Q9D516 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc130Q9D516 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc130Q9D516 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc130Q9D516 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc130Q9D516 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc130Q9D516 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc130Q9D516 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc130Q9D516 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc130Q9D516 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc130Q9D516 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc130Q9D516 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc130Q9D516 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc130Q9D516 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc130Q9D516 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc130Q9D516 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc130Q9D516 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc130Q9D516 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc130Q9D516 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc130Q9D516 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc130Q9D516 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc130Q9D516 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc130Q9D516 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc130Q9D516 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc130Q9D516 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc130Q9D516 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc130Q9D516 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc130Q9D516 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc130Q9D516 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc130Q9D516 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc130Q9D516 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc130Q9D516 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc130Q9D516 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc130Q9D516 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc130Q9D516 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc130Q9D516 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc130Q9D516 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc130Q9D516 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc130Q9D516 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc130Q9D516 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc130Q9D516 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc130Q9D516 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc130Q9D516 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc130Q9D516 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc130Q9D516 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc130Q9D516 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc130Q9D516 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc130Q9D516 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc130Q9D516 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc130Q9D516 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc130Q9D516 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc130Q9D516 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc130Q9D516 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc130Q9D516 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc130Q9D516 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc130Q9D516 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc130Q9D516 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc130Q9D516 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc130Q9D516 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc130Q9D516 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc130Q9D516 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc130Q9D516 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc130Q9D516 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc130Q9D516 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc130Q9D516 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc130Q9D516 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc130Q9D516 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc130Q9D516 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc130Q9D516 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc130Q9D516 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc130Q9D516 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc130Q9D516 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc130Q9D516 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc130Q9D516 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc130Q9D516 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc130Q9D516 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc130Q9D516 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc130Q9D516 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc130Q9D516 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc130Q9D516 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc130Q9D516 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms