Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4U4

H2al3, H2A histone family member L3, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al3Q9D4U4 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2al3Q9D4U4 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2al3Q9D4U4 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2al3Q9D4U4 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2al3Q9D4U4 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2al3Q9D4U4 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2al3Q9D4U4 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2al3Q9D4U4 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2al3Q9D4U4 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2al3Q9D4U4 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2al3Q9D4U4 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2al3Q9D4U4 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
H2al3Q9D4U4 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2al3Q9D4U4 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
H2al3Q9D4U4 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2al3Q9D4U4 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
H2al3Q9D4U4 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2al3Q9D4U4 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2al3Q9D4U4 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2al3Q9D4U4 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2al3Q9D4U4 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2al3Q9D4U4 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2al3Q9D4U4 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2al3Q9D4U4 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2al3Q9D4U4 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
H2al3Q9D4U4 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2al3Q9D4U4 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2al3Q9D4U4 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2al3Q9D4U4 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2al3Q9D4U4 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2al3Q9D4U4 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2al3Q9D4U4 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2al3Q9D4U4 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
H2al3Q9D4U4 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2al3Q9D4U4 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2al3Q9D4U4 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2al3Q9D4U4 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2al3Q9D4U4 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2al3Q9D4U4 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2al3Q9D4U4 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2al3Q9D4U4 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2al3Q9D4U4 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2al3Q9D4U4 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2al3Q9D4U4 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2al3Q9D4U4 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2al3Q9D4U4 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2al3Q9D4U4 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2al3Q9D4U4 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
H2al3Q9D4U4 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2al3Q9D4U4 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
H2al3Q9D4U4 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
H2al3Q9D4U4 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
H2al3Q9D4U4 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
H2al3Q9D4U4 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2al3Q9D4U4 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2al3Q9D4U4 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2al3Q9D4U4 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2al3Q9D4U4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2al3Q9D4U4 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2al3Q9D4U4 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2al3Q9D4U4 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2al3Q9D4U4 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2al3Q9D4U4 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2al3Q9D4U4 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2al3Q9D4U4 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2al3Q9D4U4 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2al3Q9D4U4 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2al3Q9D4U4 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2al3Q9D4U4 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2al3Q9D4U4 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2al3Q9D4U4 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2al3Q9D4U4 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2al3Q9D4U4 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2al3Q9D4U4 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2al3Q9D4U4 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2al3Q9D4U4 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2al3Q9D4U4 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2al3Q9D4U4 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2al3Q9D4U4 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2al3Q9D4U4 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2al3Q9D4U4 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2al3Q9D4U4 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2al3Q9D4U4 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2al3Q9D4U4 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2al3Q9D4U4 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2al3Q9D4U4 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
H2al3Q9D4U4 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2al3Q9D4U4 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2al3Q9D4U4 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2al3Q9D4U4 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2al3Q9D4U4 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2al3Q9D4U4 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2al3Q9D4U4 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2al3Q9D4U4 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2al3Q9D4U4 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2al3Q9D4U4 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2al3Q9D4U4 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2al3Q9D4U4 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2al3Q9D4U4 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2al3Q9D4U4 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms