Protein–RNA interactions for Protein: Q9D454

Uncharacterized protein CXorf49 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D454 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Q9D454 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Q9D454 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Q9D454 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Q9D454 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Q9D454 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Q9D454 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Q9D454 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Q9D454 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Q9D454 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Q9D454 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Q9D454 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Q9D454 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Q9D454 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Q9D454 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Q9D454 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Q9D454 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Q9D454 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Q9D454 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Q9D454 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Q9D454 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Q9D454 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Q9D454 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Q9D454 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Q9D454 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Q9D454 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Q9D454 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Q9D454 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Q9D454 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Q9D454 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Q9D454 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Q9D454 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Q9D454 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Q9D454 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Q9D454 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Q9D454 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Q9D454 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Q9D454 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Q9D454 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Q9D454 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Q9D454 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Q9D454 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Q9D454 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Q9D454 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Q9D454 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Q9D454 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Q9D454 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Q9D454 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Q9D454 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Q9D454 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Q9D454 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Q9D454 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Q9D454 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Q9D454 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Q9D454 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Q9D454 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Q9D454 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Q9D454 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Q9D454 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Q9D454 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Q9D454 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Q9D454 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Q9D454 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Q9D454 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Q9D454 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Q9D454 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Q9D454 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Q9D454 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Q9D454 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Q9D454 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Q9D454 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Q9D454 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Q9D454 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Q9D454 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Q9D454 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Q9D454 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Q9D454 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Q9D454 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Q9D454 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Q9D454 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Q9D454 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Q9D454 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Q9D454 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Q9D454 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Q9D454 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Q9D454 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Q9D454 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Q9D454 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Q9D454 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Q9D454 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Q9D454 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Q9D454 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Q9D454 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Q9D454 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Q9D454 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Q9D454 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Q9D454 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Q9D454 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Q9D454 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Q9D454 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms