Protein–RNA interactions for Protein: Q9D312

Krt20, Keratin, type I cytoskeletal 20, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt20Q9D312 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Krt20Q9D312 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Krt20Q9D312 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Krt20Q9D312 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Krt20Q9D312 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Krt20Q9D312 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Krt20Q9D312 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Krt20Q9D312 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Krt20Q9D312 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Krt20Q9D312 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Krt20Q9D312 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Krt20Q9D312 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Krt20Q9D312 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Krt20Q9D312 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Krt20Q9D312 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Krt20Q9D312 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Krt20Q9D312 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Krt20Q9D312 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Krt20Q9D312 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Krt20Q9D312 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Krt20Q9D312 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Krt20Q9D312 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Krt20Q9D312 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Krt20Q9D312 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Krt20Q9D312 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Krt20Q9D312 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Krt20Q9D312 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Krt20Q9D312 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Krt20Q9D312 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Krt20Q9D312 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Krt20Q9D312 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Krt20Q9D312 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Krt20Q9D312 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Krt20Q9D312 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Krt20Q9D312 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Krt20Q9D312 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Krt20Q9D312 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Krt20Q9D312 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Krt20Q9D312 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Krt20Q9D312 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Krt20Q9D312 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Krt20Q9D312 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Krt20Q9D312 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Krt20Q9D312 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Krt20Q9D312 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Krt20Q9D312 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Krt20Q9D312 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Krt20Q9D312 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Krt20Q9D312 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Krt20Q9D312 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Krt20Q9D312 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Krt20Q9D312 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Krt20Q9D312 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Krt20Q9D312 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Krt20Q9D312 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Krt20Q9D312 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Krt20Q9D312 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Krt20Q9D312 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Krt20Q9D312 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Krt20Q9D312 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Krt20Q9D312 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Krt20Q9D312 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Krt20Q9D312 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Krt20Q9D312 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Krt20Q9D312 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Krt20Q9D312 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Krt20Q9D312 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Krt20Q9D312 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Krt20Q9D312 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Krt20Q9D312 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Krt20Q9D312 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Krt20Q9D312 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Krt20Q9D312 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Krt20Q9D312 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Krt20Q9D312 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Krt20Q9D312 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Krt20Q9D312 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Krt20Q9D312 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Krt20Q9D312 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Krt20Q9D312 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Krt20Q9D312 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Krt20Q9D312 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Krt20Q9D312 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Krt20Q9D312 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Krt20Q9D312 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Krt20Q9D312 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Krt20Q9D312 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Krt20Q9D312 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Krt20Q9D312 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Krt20Q9D312 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Krt20Q9D312 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Krt20Q9D312 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Krt20Q9D312 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Krt20Q9D312 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Krt20Q9D312 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Krt20Q9D312 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Krt20Q9D312 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Krt20Q9D312 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Krt20Q9D312 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Krt20Q9D312 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms