Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYW4

Hdhd3, Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdhd3Q9CYW4 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hdhd3Q9CYW4 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hdhd3Q9CYW4 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hdhd3Q9CYW4 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hdhd3Q9CYW4 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hdhd3Q9CYW4 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hdhd3Q9CYW4 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hdhd3Q9CYW4 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hdhd3Q9CYW4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hdhd3Q9CYW4 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hdhd3Q9CYW4 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hdhd3Q9CYW4 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hdhd3Q9CYW4 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hdhd3Q9CYW4 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hdhd3Q9CYW4 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdhd3Q9CYW4 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdhd3Q9CYW4 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdhd3Q9CYW4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdhd3Q9CYW4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdhd3Q9CYW4 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdhd3Q9CYW4 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdhd3Q9CYW4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdhd3Q9CYW4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdhd3Q9CYW4 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdhd3Q9CYW4 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdhd3Q9CYW4 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdhd3Q9CYW4 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdhd3Q9CYW4 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hdhd3Q9CYW4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hdhd3Q9CYW4 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hdhd3Q9CYW4 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hdhd3Q9CYW4 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hdhd3Q9CYW4 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hdhd3Q9CYW4 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hdhd3Q9CYW4 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hdhd3Q9CYW4 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hdhd3Q9CYW4 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hdhd3Q9CYW4 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hdhd3Q9CYW4 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hdhd3Q9CYW4 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hdhd3Q9CYW4 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hdhd3Q9CYW4 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hdhd3Q9CYW4 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hdhd3Q9CYW4 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hdhd3Q9CYW4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hdhd3Q9CYW4 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hdhd3Q9CYW4 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hdhd3Q9CYW4 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hdhd3Q9CYW4 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hdhd3Q9CYW4 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hdhd3Q9CYW4 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hdhd3Q9CYW4 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hdhd3Q9CYW4 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Hdhd3Q9CYW4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hdhd3Q9CYW4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hdhd3Q9CYW4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hdhd3Q9CYW4 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hdhd3Q9CYW4 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hdhd3Q9CYW4 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hdhd3Q9CYW4 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hdhd3Q9CYW4 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hdhd3Q9CYW4 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hdhd3Q9CYW4 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hdhd3Q9CYW4 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hdhd3Q9CYW4 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hdhd3Q9CYW4 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hdhd3Q9CYW4 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hdhd3Q9CYW4 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hdhd3Q9CYW4 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hdhd3Q9CYW4 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hdhd3Q9CYW4 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hdhd3Q9CYW4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hdhd3Q9CYW4 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hdhd3Q9CYW4 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hdhd3Q9CYW4 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hdhd3Q9CYW4 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hdhd3Q9CYW4 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hdhd3Q9CYW4 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hdhd3Q9CYW4 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hdhd3Q9CYW4 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hdhd3Q9CYW4 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hdhd3Q9CYW4 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hdhd3Q9CYW4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hdhd3Q9CYW4 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hdhd3Q9CYW4 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hdhd3Q9CYW4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hdhd3Q9CYW4 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hdhd3Q9CYW4 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hdhd3Q9CYW4 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hdhd3Q9CYW4 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hdhd3Q9CYW4 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hdhd3Q9CYW4 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hdhd3Q9CYW4 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hdhd3Q9CYW4 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hdhd3Q9CYW4 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hdhd3Q9CYW4 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hdhd3Q9CYW4 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hdhd3Q9CYW4 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hdhd3Q9CYW4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Hdhd3Q9CYW4 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms