Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXT8

Pmpcb, Mitochondrial-processing peptidase subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmpcbQ9CXT8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PmpcbQ9CXT8 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PmpcbQ9CXT8 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PmpcbQ9CXT8 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PmpcbQ9CXT8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PmpcbQ9CXT8 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PmpcbQ9CXT8 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PmpcbQ9CXT8 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PmpcbQ9CXT8 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PmpcbQ9CXT8 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PmpcbQ9CXT8 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PmpcbQ9CXT8 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PmpcbQ9CXT8 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PmpcbQ9CXT8 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PmpcbQ9CXT8 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PmpcbQ9CXT8 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PmpcbQ9CXT8 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PmpcbQ9CXT8 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PmpcbQ9CXT8 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PmpcbQ9CXT8 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PmpcbQ9CXT8 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PmpcbQ9CXT8 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PmpcbQ9CXT8 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PmpcbQ9CXT8 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PmpcbQ9CXT8 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PmpcbQ9CXT8 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PmpcbQ9CXT8 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PmpcbQ9CXT8 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PmpcbQ9CXT8 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PmpcbQ9CXT8 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PmpcbQ9CXT8 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PmpcbQ9CXT8 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PmpcbQ9CXT8 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PmpcbQ9CXT8 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PmpcbQ9CXT8 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PmpcbQ9CXT8 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PmpcbQ9CXT8 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PmpcbQ9CXT8 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PmpcbQ9CXT8 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PmpcbQ9CXT8 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PmpcbQ9CXT8 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PmpcbQ9CXT8 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PmpcbQ9CXT8 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PmpcbQ9CXT8 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PmpcbQ9CXT8 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PmpcbQ9CXT8 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PmpcbQ9CXT8 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PmpcbQ9CXT8 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PmpcbQ9CXT8 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PmpcbQ9CXT8 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PmpcbQ9CXT8 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PmpcbQ9CXT8 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PmpcbQ9CXT8 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PmpcbQ9CXT8 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PmpcbQ9CXT8 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PmpcbQ9CXT8 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PmpcbQ9CXT8 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PmpcbQ9CXT8 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PmpcbQ9CXT8 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PmpcbQ9CXT8 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PmpcbQ9CXT8 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PmpcbQ9CXT8 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PmpcbQ9CXT8 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PmpcbQ9CXT8 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PmpcbQ9CXT8 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PmpcbQ9CXT8 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PmpcbQ9CXT8 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PmpcbQ9CXT8 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PmpcbQ9CXT8 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PmpcbQ9CXT8 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PmpcbQ9CXT8 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PmpcbQ9CXT8 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PmpcbQ9CXT8 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PmpcbQ9CXT8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PmpcbQ9CXT8 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PmpcbQ9CXT8 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PmpcbQ9CXT8 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PmpcbQ9CXT8 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PmpcbQ9CXT8 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PmpcbQ9CXT8 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PmpcbQ9CXT8 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PmpcbQ9CXT8 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PmpcbQ9CXT8 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PmpcbQ9CXT8 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PmpcbQ9CXT8 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PmpcbQ9CXT8 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PmpcbQ9CXT8 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PmpcbQ9CXT8 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PmpcbQ9CXT8 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PmpcbQ9CXT8 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PmpcbQ9CXT8 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PmpcbQ9CXT8 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PmpcbQ9CXT8 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PmpcbQ9CXT8 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PmpcbQ9CXT8 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PmpcbQ9CXT8 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PmpcbQ9CXT8 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PmpcbQ9CXT8 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PmpcbQ9CXT8 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PmpcbQ9CXT8 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms