Protein–RNA interactions for Protein: Q99P51

Rassf3, Ras association domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rassf3Q99P51 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rassf3Q99P51 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rassf3Q99P51 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rassf3Q99P51 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rassf3Q99P51 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rassf3Q99P51 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rassf3Q99P51 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rassf3Q99P51 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rassf3Q99P51 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rassf3Q99P51 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rassf3Q99P51 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rassf3Q99P51 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rassf3Q99P51 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rassf3Q99P51 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rassf3Q99P51 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rassf3Q99P51 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rassf3Q99P51 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rassf3Q99P51 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rassf3Q99P51 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rassf3Q99P51 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rassf3Q99P51 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Rassf3Q99P51 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rassf3Q99P51 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rassf3Q99P51 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rassf3Q99P51 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rassf3Q99P51 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rassf3Q99P51 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rassf3Q99P51 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rassf3Q99P51 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rassf3Q99P51 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rassf3Q99P51 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rassf3Q99P51 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rassf3Q99P51 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rassf3Q99P51 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Rassf3Q99P51 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rassf3Q99P51 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rassf3Q99P51 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rassf3Q99P51 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rassf3Q99P51 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rassf3Q99P51 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rassf3Q99P51 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Rassf3Q99P51 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Rassf3Q99P51 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Rassf3Q99P51 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rassf3Q99P51 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rassf3Q99P51 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rassf3Q99P51 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rassf3Q99P51 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rassf3Q99P51 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rassf3Q99P51 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rassf3Q99P51 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rassf3Q99P51 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rassf3Q99P51 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Rassf3Q99P51 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rassf3Q99P51 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rassf3Q99P51 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rassf3Q99P51 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rassf3Q99P51 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rassf3Q99P51 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rassf3Q99P51 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Rassf3Q99P51 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Rassf3Q99P51 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Rassf3Q99P51 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Rassf3Q99P51 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Rassf3Q99P51 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Rassf3Q99P51 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rassf3Q99P51 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Rassf3Q99P51 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Rassf3Q99P51 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rassf3Q99P51 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rassf3Q99P51 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rassf3Q99P51 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rassf3Q99P51 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rassf3Q99P51 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rassf3Q99P51 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rassf3Q99P51 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rassf3Q99P51 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rassf3Q99P51 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rassf3Q99P51 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rassf3Q99P51 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rassf3Q99P51 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rassf3Q99P51 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rassf3Q99P51 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rassf3Q99P51 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rassf3Q99P51 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rassf3Q99P51 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rassf3Q99P51 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Rassf3Q99P51 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Rassf3Q99P51 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rassf3Q99P51 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rassf3Q99P51 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rassf3Q99P51 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rassf3Q99P51 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rassf3Q99P51 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rassf3Q99P51 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rassf3Q99P51 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rassf3Q99P51 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rassf3Q99P51 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rassf3Q99P51 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rassf3Q99P51 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms