Protein–RNA interactions for Protein: Q99NC0

Vgll1, Transcription cofactor vestigial-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll1Q99NC0 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vgll1Q99NC0 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vgll1Q99NC0 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vgll1Q99NC0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vgll1Q99NC0 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vgll1Q99NC0 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vgll1Q99NC0 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vgll1Q99NC0 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vgll1Q99NC0 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vgll1Q99NC0 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vgll1Q99NC0 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vgll1Q99NC0 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vgll1Q99NC0 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vgll1Q99NC0 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vgll1Q99NC0 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vgll1Q99NC0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vgll1Q99NC0 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vgll1Q99NC0 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vgll1Q99NC0 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vgll1Q99NC0 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vgll1Q99NC0 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vgll1Q99NC0 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vgll1Q99NC0 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vgll1Q99NC0 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vgll1Q99NC0 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vgll1Q99NC0 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vgll1Q99NC0 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vgll1Q99NC0 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vgll1Q99NC0 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vgll1Q99NC0 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vgll1Q99NC0 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vgll1Q99NC0 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vgll1Q99NC0 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vgll1Q99NC0 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vgll1Q99NC0 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vgll1Q99NC0 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vgll1Q99NC0 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vgll1Q99NC0 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vgll1Q99NC0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Vgll1Q99NC0 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vgll1Q99NC0 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vgll1Q99NC0 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vgll1Q99NC0 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vgll1Q99NC0 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vgll1Q99NC0 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vgll1Q99NC0 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vgll1Q99NC0 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vgll1Q99NC0 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vgll1Q99NC0 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vgll1Q99NC0 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Vgll1Q99NC0 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vgll1Q99NC0 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vgll1Q99NC0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vgll1Q99NC0 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vgll1Q99NC0 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vgll1Q99NC0 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vgll1Q99NC0 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vgll1Q99NC0 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vgll1Q99NC0 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vgll1Q99NC0 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vgll1Q99NC0 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vgll1Q99NC0 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vgll1Q99NC0 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vgll1Q99NC0 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vgll1Q99NC0 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vgll1Q99NC0 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vgll1Q99NC0 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vgll1Q99NC0 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vgll1Q99NC0 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vgll1Q99NC0 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vgll1Q99NC0 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vgll1Q99NC0 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vgll1Q99NC0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vgll1Q99NC0 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vgll1Q99NC0 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Vgll1Q99NC0 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Vgll1Q99NC0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vgll1Q99NC0 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vgll1Q99NC0 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vgll1Q99NC0 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Vgll1Q99NC0 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vgll1Q99NC0 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Vgll1Q99NC0 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vgll1Q99NC0 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vgll1Q99NC0 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vgll1Q99NC0 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vgll1Q99NC0 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vgll1Q99NC0 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vgll1Q99NC0 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vgll1Q99NC0 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vgll1Q99NC0 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vgll1Q99NC0 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vgll1Q99NC0 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vgll1Q99NC0 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vgll1Q99NC0 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vgll1Q99NC0 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vgll1Q99NC0 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vgll1Q99NC0 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vgll1Q99NC0 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vgll1Q99NC0 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms