Protein–RNA interactions for Protein: Q99L48

Nmd3, 60S ribosomal export protein NMD3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nmd3Q99L48 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nmd3Q99L48 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nmd3Q99L48 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nmd3Q99L48 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nmd3Q99L48 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nmd3Q99L48 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nmd3Q99L48 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nmd3Q99L48 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nmd3Q99L48 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nmd3Q99L48 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nmd3Q99L48 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nmd3Q99L48 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nmd3Q99L48 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nmd3Q99L48 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nmd3Q99L48 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nmd3Q99L48 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nmd3Q99L48 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nmd3Q99L48 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nmd3Q99L48 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nmd3Q99L48 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nmd3Q99L48 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nmd3Q99L48 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Nmd3Q99L48 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nmd3Q99L48 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nmd3Q99L48 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nmd3Q99L48 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nmd3Q99L48 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nmd3Q99L48 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Nmd3Q99L48 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Nmd3Q99L48 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nmd3Q99L48 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nmd3Q99L48 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nmd3Q99L48 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nmd3Q99L48 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nmd3Q99L48 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nmd3Q99L48 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nmd3Q99L48 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nmd3Q99L48 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nmd3Q99L48 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nmd3Q99L48 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nmd3Q99L48 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nmd3Q99L48 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nmd3Q99L48 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nmd3Q99L48 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nmd3Q99L48 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nmd3Q99L48 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nmd3Q99L48 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nmd3Q99L48 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nmd3Q99L48 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nmd3Q99L48 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nmd3Q99L48 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nmd3Q99L48 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nmd3Q99L48 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nmd3Q99L48 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nmd3Q99L48 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Nmd3Q99L48 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nmd3Q99L48 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nmd3Q99L48 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Nmd3Q99L48 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nmd3Q99L48 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nmd3Q99L48 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nmd3Q99L48 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nmd3Q99L48 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nmd3Q99L48 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nmd3Q99L48 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nmd3Q99L48 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nmd3Q99L48 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nmd3Q99L48 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nmd3Q99L48 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nmd3Q99L48 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nmd3Q99L48 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nmd3Q99L48 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nmd3Q99L48 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nmd3Q99L48 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nmd3Q99L48 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Nmd3Q99L48 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nmd3Q99L48 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nmd3Q99L48 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nmd3Q99L48 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nmd3Q99L48 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nmd3Q99L48 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nmd3Q99L48 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nmd3Q99L48 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nmd3Q99L48 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nmd3Q99L48 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nmd3Q99L48 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nmd3Q99L48 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nmd3Q99L48 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nmd3Q99L48 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nmd3Q99L48 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nmd3Q99L48 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nmd3Q99L48 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nmd3Q99L48 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nmd3Q99L48 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nmd3Q99L48 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nmd3Q99L48 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nmd3Q99L48 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nmd3Q99L48 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nmd3Q99L48 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nmd3Q99L48 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms