Protein–RNA interactions for Protein: Q99KW3

Triobp, TRIO and F-actin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TriobpQ99KW3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TriobpQ99KW3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TriobpQ99KW3 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TriobpQ99KW3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TriobpQ99KW3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TriobpQ99KW3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TriobpQ99KW3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TriobpQ99KW3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TriobpQ99KW3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TriobpQ99KW3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TriobpQ99KW3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TriobpQ99KW3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TriobpQ99KW3 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TriobpQ99KW3 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TriobpQ99KW3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TriobpQ99KW3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
TriobpQ99KW3 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TriobpQ99KW3 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TriobpQ99KW3 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TriobpQ99KW3 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
TriobpQ99KW3 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TriobpQ99KW3 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TriobpQ99KW3 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TriobpQ99KW3 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TriobpQ99KW3 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TriobpQ99KW3 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TriobpQ99KW3 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TriobpQ99KW3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TriobpQ99KW3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TriobpQ99KW3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TriobpQ99KW3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TriobpQ99KW3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TriobpQ99KW3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TriobpQ99KW3 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TriobpQ99KW3 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TriobpQ99KW3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TriobpQ99KW3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TriobpQ99KW3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TriobpQ99KW3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TriobpQ99KW3 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TriobpQ99KW3 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TriobpQ99KW3 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TriobpQ99KW3 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TriobpQ99KW3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TriobpQ99KW3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TriobpQ99KW3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TriobpQ99KW3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TriobpQ99KW3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TriobpQ99KW3 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
TriobpQ99KW3 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
TriobpQ99KW3 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TriobpQ99KW3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TriobpQ99KW3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TriobpQ99KW3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TriobpQ99KW3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TriobpQ99KW3 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TriobpQ99KW3 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TriobpQ99KW3 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TriobpQ99KW3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TriobpQ99KW3 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TriobpQ99KW3 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TriobpQ99KW3 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TriobpQ99KW3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TriobpQ99KW3 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TriobpQ99KW3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TriobpQ99KW3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TriobpQ99KW3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TriobpQ99KW3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TriobpQ99KW3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TriobpQ99KW3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TriobpQ99KW3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TriobpQ99KW3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TriobpQ99KW3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TriobpQ99KW3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TriobpQ99KW3 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
TriobpQ99KW3 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TriobpQ99KW3 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TriobpQ99KW3 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TriobpQ99KW3 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TriobpQ99KW3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TriobpQ99KW3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TriobpQ99KW3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TriobpQ99KW3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TriobpQ99KW3 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TriobpQ99KW3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TriobpQ99KW3 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TriobpQ99KW3 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TriobpQ99KW3 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TriobpQ99KW3 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TriobpQ99KW3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TriobpQ99KW3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TriobpQ99KW3 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TriobpQ99KW3 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TriobpQ99KW3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TriobpQ99KW3 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TriobpQ99KW3 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TriobpQ99KW3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
TriobpQ99KW3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TriobpQ99KW3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TriobpQ99KW3 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms