Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ddb2Q99J79 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ddb2Q99J79 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ddb2Q99J79 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ddb2Q99J79 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ddb2Q99J79 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ddb2Q99J79 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ddb2Q99J79 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ddb2Q99J79 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ddb2Q99J79 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ddb2Q99J79 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ddb2Q99J79 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ddb2Q99J79 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ddb2Q99J79 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ddb2Q99J79 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ddb2Q99J79 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ddb2Q99J79 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ddb2Q99J79 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ddb2Q99J79 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ddb2Q99J79 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ddb2Q99J79 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ddb2Q99J79 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ddb2Q99J79 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ddb2Q99J79 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ddb2Q99J79 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ddb2Q99J79 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ddb2Q99J79 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ddb2Q99J79 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ddb2Q99J79 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ddb2Q99J79 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ddb2Q99J79 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ddb2Q99J79 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ddb2Q99J79 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ddb2Q99J79 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ddb2Q99J79 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ddb2Q99J79 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ddb2Q99J79 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ddb2Q99J79 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ddb2Q99J79 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ddb2Q99J79 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ddb2Q99J79 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ddb2Q99J79 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ddb2Q99J79 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ddb2Q99J79 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ddb2Q99J79 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ddb2Q99J79 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ddb2Q99J79 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ddb2Q99J79 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ddb2Q99J79 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ddb2Q99J79 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ddb2Q99J79 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ddb2Q99J79 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ddb2Q99J79 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ddb2Q99J79 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ddb2Q99J79 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ddb2Q99J79 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ddb2Q99J79 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ddb2Q99J79 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ddb2Q99J79 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ddb2Q99J79 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ddb2Q99J79 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ddb2Q99J79 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ddb2Q99J79 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ddb2Q99J79 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ddb2Q99J79 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ddb2Q99J79 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ddb2Q99J79 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ddb2Q99J79 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ddb2Q99J79 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ddb2Q99J79 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ddb2Q99J79 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ddb2Q99J79 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ddb2Q99J79 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ddb2Q99J79 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ddb2Q99J79 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ddb2Q99J79 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ddb2Q99J79 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ddb2Q99J79 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ddb2Q99J79 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ddb2Q99J79 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ddb2Q99J79 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ddb2Q99J79 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ddb2Q99J79 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ddb2Q99J79 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ddb2Q99J79 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ddb2Q99J79 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ddb2Q99J79 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ddb2Q99J79 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ddb2Q99J79 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ddb2Q99J79 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ddb2Q99J79 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ddb2Q99J79 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ddb2Q99J79 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ddb2Q99J79 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ddb2Q99J79 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ddb2Q99J79 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ddb2Q99J79 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ddb2Q99J79 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ddb2Q99J79 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ddb2Q99J79 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms