Protein–RNA interactions for Protein: Q99081

TCF12, Transcription factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF12Q99081 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TCF12Q99081 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TCF12Q99081 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TCF12Q99081 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TCF12Q99081 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TCF12Q99081 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TCF12Q99081 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TCF12Q99081 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TCF12Q99081 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TCF12Q99081 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TCF12Q99081 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TCF12Q99081 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TCF12Q99081 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TCF12Q99081 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TCF12Q99081 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TCF12Q99081 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TCF12Q99081 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TCF12Q99081 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TCF12Q99081 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TCF12Q99081 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TCF12Q99081 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TCF12Q99081 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TCF12Q99081 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TCF12Q99081 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TCF12Q99081 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TCF12Q99081 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TCF12Q99081 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TCF12Q99081 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TCF12Q99081 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TCF12Q99081 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TCF12Q99081 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TCF12Q99081 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TCF12Q99081 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TCF12Q99081 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TCF12Q99081 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
TCF12Q99081 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TCF12Q99081 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TCF12Q99081 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TCF12Q99081 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TCF12Q99081 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TCF12Q99081 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TCF12Q99081 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TCF12Q99081 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TCF12Q99081 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TCF12Q99081 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TCF12Q99081 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TCF12Q99081 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
TCF12Q99081 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TCF12Q99081 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TCF12Q99081 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TCF12Q99081 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TCF12Q99081 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TCF12Q99081 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TCF12Q99081 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TCF12Q99081 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TCF12Q99081 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TCF12Q99081 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TCF12Q99081 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
TCF12Q99081 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TCF12Q99081 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TCF12Q99081 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TCF12Q99081 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TCF12Q99081 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TCF12Q99081 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TCF12Q99081 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TCF12Q99081 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TCF12Q99081 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TCF12Q99081 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TCF12Q99081 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TCF12Q99081 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TCF12Q99081 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TCF12Q99081 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TCF12Q99081 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TCF12Q99081 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TCF12Q99081 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TCF12Q99081 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TCF12Q99081 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
TCF12Q99081 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TCF12Q99081 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TCF12Q99081 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TCF12Q99081 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TCF12Q99081 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TCF12Q99081 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TCF12Q99081 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TCF12Q99081 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TCF12Q99081 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TCF12Q99081 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TCF12Q99081 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TCF12Q99081 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TCF12Q99081 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TCF12Q99081 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TCF12Q99081 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TCF12Q99081 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TCF12Q99081 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
TCF12Q99081 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TCF12Q99081 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TCF12Q99081 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TCF12Q99081 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TCF12Q99081 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TCF12Q99081 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms