Protein–RNA interactions for Protein: Q96CS3

FAF2, FAS-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAF2Q96CS3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAF2Q96CS3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAF2Q96CS3 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAF2Q96CS3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAF2Q96CS3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAF2Q96CS3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAF2Q96CS3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
FAF2Q96CS3 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAF2Q96CS3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAF2Q96CS3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAF2Q96CS3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAF2Q96CS3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAF2Q96CS3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAF2Q96CS3 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAF2Q96CS3 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAF2Q96CS3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAF2Q96CS3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
FAF2Q96CS3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
FAF2Q96CS3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
FAF2Q96CS3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
FAF2Q96CS3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAF2Q96CS3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAF2Q96CS3 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAF2Q96CS3 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAF2Q96CS3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAF2Q96CS3 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAF2Q96CS3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAF2Q96CS3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAF2Q96CS3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FAF2Q96CS3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAF2Q96CS3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAF2Q96CS3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAF2Q96CS3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FAF2Q96CS3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAF2Q96CS3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAF2Q96CS3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAF2Q96CS3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAF2Q96CS3 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAF2Q96CS3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAF2Q96CS3 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
FAF2Q96CS3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAF2Q96CS3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAF2Q96CS3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAF2Q96CS3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAF2Q96CS3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAF2Q96CS3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAF2Q96CS3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAF2Q96CS3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAF2Q96CS3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAF2Q96CS3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAF2Q96CS3 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAF2Q96CS3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAF2Q96CS3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAF2Q96CS3 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAF2Q96CS3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAF2Q96CS3 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAF2Q96CS3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
FAF2Q96CS3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAF2Q96CS3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAF2Q96CS3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAF2Q96CS3 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAF2Q96CS3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAF2Q96CS3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAF2Q96CS3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAF2Q96CS3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAF2Q96CS3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAF2Q96CS3 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAF2Q96CS3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAF2Q96CS3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAF2Q96CS3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAF2Q96CS3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAF2Q96CS3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAF2Q96CS3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAF2Q96CS3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAF2Q96CS3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAF2Q96CS3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAF2Q96CS3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAF2Q96CS3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAF2Q96CS3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAF2Q96CS3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAF2Q96CS3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAF2Q96CS3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
FAF2Q96CS3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAF2Q96CS3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAF2Q96CS3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAF2Q96CS3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAF2Q96CS3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAF2Q96CS3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAF2Q96CS3 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAF2Q96CS3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAF2Q96CS3 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAF2Q96CS3 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAF2Q96CS3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAF2Q96CS3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAF2Q96CS3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAF2Q96CS3 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAF2Q96CS3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
FAF2Q96CS3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAF2Q96CS3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAF2Q96CS3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms