Protein–RNA interactions for Protein: Q924S9

Ripply3, Protein ripply3, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripply3Q924S9 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ripply3Q924S9 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ripply3Q924S9 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ripply3Q924S9 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ripply3Q924S9 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ripply3Q924S9 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ripply3Q924S9 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ripply3Q924S9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ripply3Q924S9 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ripply3Q924S9 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ripply3Q924S9 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ripply3Q924S9 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ripply3Q924S9 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ripply3Q924S9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ripply3Q924S9 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ripply3Q924S9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ripply3Q924S9 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ripply3Q924S9 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ripply3Q924S9 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ripply3Q924S9 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ripply3Q924S9 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ripply3Q924S9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ripply3Q924S9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ripply3Q924S9 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ripply3Q924S9 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ripply3Q924S9 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ripply3Q924S9 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ripply3Q924S9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ripply3Q924S9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ripply3Q924S9 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ripply3Q924S9 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ripply3Q924S9 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ripply3Q924S9 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ripply3Q924S9 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ripply3Q924S9 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ripply3Q924S9 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ripply3Q924S9 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ripply3Q924S9 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ripply3Q924S9 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ripply3Q924S9 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ripply3Q924S9 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ripply3Q924S9 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ripply3Q924S9 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ripply3Q924S9 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ripply3Q924S9 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ripply3Q924S9 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ripply3Q924S9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ripply3Q924S9 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ripply3Q924S9 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ripply3Q924S9 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ripply3Q924S9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ripply3Q924S9 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ripply3Q924S9 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ripply3Q924S9 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ripply3Q924S9 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ripply3Q924S9 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ripply3Q924S9 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ripply3Q924S9 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ripply3Q924S9 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ripply3Q924S9 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ripply3Q924S9 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ripply3Q924S9 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ripply3Q924S9 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ripply3Q924S9 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ripply3Q924S9 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ripply3Q924S9 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ripply3Q924S9 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ripply3Q924S9 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ripply3Q924S9 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ripply3Q924S9 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ripply3Q924S9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ripply3Q924S9 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ripply3Q924S9 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ripply3Q924S9 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ripply3Q924S9 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ripply3Q924S9 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ripply3Q924S9 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ripply3Q924S9 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ripply3Q924S9 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ripply3Q924S9 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ripply3Q924S9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ripply3Q924S9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ripply3Q924S9 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ripply3Q924S9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ripply3Q924S9 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ripply3Q924S9 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ripply3Q924S9 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ripply3Q924S9 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ripply3Q924S9 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ripply3Q924S9 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ripply3Q924S9 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ripply3Q924S9 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ripply3Q924S9 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ripply3Q924S9 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ripply3Q924S9 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ripply3Q924S9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ripply3Q924S9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ripply3Q924S9 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ripply3Q924S9 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ripply3Q924S9 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms