Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZP4

Slc5a4b, MCG3105, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a4bQ91ZP4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Slc5a4bQ91ZP4 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Slc5a4bQ91ZP4 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Slc5a4bQ91ZP4 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Slc5a4bQ91ZP4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Slc5a4bQ91ZP4 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Slc5a4bQ91ZP4 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Slc5a4bQ91ZP4 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Slc5a4bQ91ZP4 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Slc5a4bQ91ZP4 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Slc5a4bQ91ZP4 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Slc5a4bQ91ZP4 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Slc5a4bQ91ZP4 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Slc5a4bQ91ZP4 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Slc5a4bQ91ZP4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Slc5a4bQ91ZP4 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Slc5a4bQ91ZP4 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Slc5a4bQ91ZP4 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Slc5a4bQ91ZP4 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Slc5a4bQ91ZP4 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Slc5a4bQ91ZP4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Slc5a4bQ91ZP4 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Slc5a4bQ91ZP4 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Slc5a4bQ91ZP4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Slc5a4bQ91ZP4 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Slc5a4bQ91ZP4 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Slc5a4bQ91ZP4 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Slc5a4bQ91ZP4 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Slc5a4bQ91ZP4 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Slc5a4bQ91ZP4 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Slc5a4bQ91ZP4 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Slc5a4bQ91ZP4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Slc5a4bQ91ZP4 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Slc5a4bQ91ZP4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Slc5a4bQ91ZP4 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Slc5a4bQ91ZP4 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Slc5a4bQ91ZP4 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Slc5a4bQ91ZP4 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Slc5a4bQ91ZP4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Slc5a4bQ91ZP4 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slc5a4bQ91ZP4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slc5a4bQ91ZP4 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slc5a4bQ91ZP4 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slc5a4bQ91ZP4 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slc5a4bQ91ZP4 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slc5a4bQ91ZP4 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slc5a4bQ91ZP4 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slc5a4bQ91ZP4 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slc5a4bQ91ZP4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slc5a4bQ91ZP4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slc5a4bQ91ZP4 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slc5a4bQ91ZP4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Slc5a4bQ91ZP4 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Slc5a4bQ91ZP4 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Slc5a4bQ91ZP4 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Slc5a4bQ91ZP4 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Slc5a4bQ91ZP4 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Slc5a4bQ91ZP4 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Slc5a4bQ91ZP4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Slc5a4bQ91ZP4 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Slc5a4bQ91ZP4 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Slc5a4bQ91ZP4 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Slc5a4bQ91ZP4 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Slc5a4bQ91ZP4 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Slc5a4bQ91ZP4 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Slc5a4bQ91ZP4 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Slc5a4bQ91ZP4 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Slc5a4bQ91ZP4 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Slc5a4bQ91ZP4 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Slc5a4bQ91ZP4 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Slc5a4bQ91ZP4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Slc5a4bQ91ZP4 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Slc5a4bQ91ZP4 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Slc5a4bQ91ZP4 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Slc5a4bQ91ZP4 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Slc5a4bQ91ZP4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Slc5a4bQ91ZP4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Slc5a4bQ91ZP4 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Slc5a4bQ91ZP4 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Slc5a4bQ91ZP4 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Slc5a4bQ91ZP4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Slc5a4bQ91ZP4 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Slc5a4bQ91ZP4 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Slc5a4bQ91ZP4 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Slc5a4bQ91ZP4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Slc5a4bQ91ZP4 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Slc5a4bQ91ZP4 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Slc5a4bQ91ZP4 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Slc5a4bQ91ZP4 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Slc5a4bQ91ZP4 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Slc5a4bQ91ZP4 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Slc5a4bQ91ZP4 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Slc5a4bQ91ZP4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Slc5a4bQ91ZP4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Slc5a4bQ91ZP4 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Slc5a4bQ91ZP4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Slc5a4bQ91ZP4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Slc5a4bQ91ZP4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Slc5a4bQ91ZP4 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Slc5a4bQ91ZP4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms