Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC31

Ccdc9, Coiled-coil domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc9Q8VC31 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc9Q8VC31 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc9Q8VC31 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc9Q8VC31 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc9Q8VC31 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc9Q8VC31 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc9Q8VC31 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc9Q8VC31 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc9Q8VC31 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc9Q8VC31 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc9Q8VC31 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc9Q8VC31 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc9Q8VC31 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc9Q8VC31 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc9Q8VC31 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc9Q8VC31 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc9Q8VC31 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc9Q8VC31 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc9Q8VC31 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc9Q8VC31 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc9Q8VC31 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc9Q8VC31 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc9Q8VC31 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc9Q8VC31 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc9Q8VC31 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc9Q8VC31 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc9Q8VC31 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc9Q8VC31 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc9Q8VC31 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc9Q8VC31 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc9Q8VC31 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc9Q8VC31 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc9Q8VC31 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc9Q8VC31 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc9Q8VC31 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc9Q8VC31 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc9Q8VC31 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc9Q8VC31 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc9Q8VC31 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc9Q8VC31 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc9Q8VC31 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc9Q8VC31 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc9Q8VC31 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc9Q8VC31 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc9Q8VC31 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc9Q8VC31 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc9Q8VC31 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc9Q8VC31 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc9Q8VC31 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc9Q8VC31 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc9Q8VC31 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc9Q8VC31 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc9Q8VC31 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc9Q8VC31 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc9Q8VC31 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc9Q8VC31 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc9Q8VC31 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc9Q8VC31 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc9Q8VC31 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc9Q8VC31 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc9Q8VC31 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc9Q8VC31 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc9Q8VC31 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc9Q8VC31 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc9Q8VC31 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc9Q8VC31 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc9Q8VC31 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc9Q8VC31 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc9Q8VC31 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc9Q8VC31 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc9Q8VC31 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc9Q8VC31 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc9Q8VC31 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc9Q8VC31 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc9Q8VC31 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc9Q8VC31 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc9Q8VC31 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc9Q8VC31 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc9Q8VC31 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc9Q8VC31 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc9Q8VC31 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc9Q8VC31 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc9Q8VC31 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc9Q8VC31 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc9Q8VC31 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc9Q8VC31 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc9Q8VC31 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc9Q8VC31 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc9Q8VC31 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc9Q8VC31 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc9Q8VC31 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc9Q8VC31 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc9Q8VC31 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc9Q8VC31 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc9Q8VC31 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc9Q8VC31 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc9Q8VC31 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc9Q8VC31 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc9Q8VC31 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc9Q8VC31 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms