Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc12Q8R344 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc12Q8R344 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc12Q8R344 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc12Q8R344 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc12Q8R344 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc12Q8R344 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc12Q8R344 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc12Q8R344 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc12Q8R344 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc12Q8R344 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc12Q8R344 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc12Q8R344 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc12Q8R344 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc12Q8R344 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc12Q8R344 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc12Q8R344 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc12Q8R344 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc12Q8R344 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc12Q8R344 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc12Q8R344 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc12Q8R344 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc12Q8R344 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc12Q8R344 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc12Q8R344 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc12Q8R344 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc12Q8R344 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc12Q8R344 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc12Q8R344 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc12Q8R344 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc12Q8R344 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc12Q8R344 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc12Q8R344 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc12Q8R344 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc12Q8R344 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc12Q8R344 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc12Q8R344 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc12Q8R344 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc12Q8R344 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc12Q8R344 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc12Q8R344 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc12Q8R344 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc12Q8R344 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc12Q8R344 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc12Q8R344 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc12Q8R344 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ccdc12Q8R344 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc12Q8R344 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc12Q8R344 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc12Q8R344 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc12Q8R344 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc12Q8R344 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccdc12Q8R344 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc12Q8R344 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc12Q8R344 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc12Q8R344 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc12Q8R344 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc12Q8R344 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc12Q8R344 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc12Q8R344 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc12Q8R344 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc12Q8R344 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc12Q8R344 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc12Q8R344 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc12Q8R344 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc12Q8R344 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc12Q8R344 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc12Q8R344 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc12Q8R344 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc12Q8R344 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc12Q8R344 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc12Q8R344 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc12Q8R344 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc12Q8R344 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc12Q8R344 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc12Q8R344 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc12Q8R344 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc12Q8R344 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc12Q8R344 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc12Q8R344 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc12Q8R344 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc12Q8R344 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc12Q8R344 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc12Q8R344 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc12Q8R344 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc12Q8R344 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc12Q8R344 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc12Q8R344 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc12Q8R344 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc12Q8R344 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc12Q8R344 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc12Q8R344 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc12Q8R344 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc12Q8R344 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc12Q8R344 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc12Q8R344 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc12Q8R344 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc12Q8R344 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc12Q8R344 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc12Q8R344 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms