Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1P4

Atg10, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG10, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg10Q8R1P4 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atg10Q8R1P4 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atg10Q8R1P4 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Atg10Q8R1P4 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Atg10Q8R1P4 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atg10Q8R1P4 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atg10Q8R1P4 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atg10Q8R1P4 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Atg10Q8R1P4 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atg10Q8R1P4 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atg10Q8R1P4 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atg10Q8R1P4 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atg10Q8R1P4 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Atg10Q8R1P4 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atg10Q8R1P4 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atg10Q8R1P4 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atg10Q8R1P4 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atg10Q8R1P4 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atg10Q8R1P4 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atg10Q8R1P4 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Atg10Q8R1P4 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atg10Q8R1P4 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atg10Q8R1P4 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atg10Q8R1P4 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atg10Q8R1P4 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atg10Q8R1P4 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Atg10Q8R1P4 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atg10Q8R1P4 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atg10Q8R1P4 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atg10Q8R1P4 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atg10Q8R1P4 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atg10Q8R1P4 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atg10Q8R1P4 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atg10Q8R1P4 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atg10Q8R1P4 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atg10Q8R1P4 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atg10Q8R1P4 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atg10Q8R1P4 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atg10Q8R1P4 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atg10Q8R1P4 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atg10Q8R1P4 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Atg10Q8R1P4 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atg10Q8R1P4 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atg10Q8R1P4 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atg10Q8R1P4 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atg10Q8R1P4 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atg10Q8R1P4 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atg10Q8R1P4 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Atg10Q8R1P4 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atg10Q8R1P4 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atg10Q8R1P4 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atg10Q8R1P4 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atg10Q8R1P4 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atg10Q8R1P4 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Atg10Q8R1P4 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atg10Q8R1P4 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atg10Q8R1P4 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atg10Q8R1P4 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Atg10Q8R1P4 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atg10Q8R1P4 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atg10Q8R1P4 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atg10Q8R1P4 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atg10Q8R1P4 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atg10Q8R1P4 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atg10Q8R1P4 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atg10Q8R1P4 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atg10Q8R1P4 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atg10Q8R1P4 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atg10Q8R1P4 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Atg10Q8R1P4 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Atg10Q8R1P4 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Atg10Q8R1P4 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Atg10Q8R1P4 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Atg10Q8R1P4 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Atg10Q8R1P4 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Atg10Q8R1P4 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Atg10Q8R1P4 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Atg10Q8R1P4 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Atg10Q8R1P4 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Atg10Q8R1P4 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Atg10Q8R1P4 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Atg10Q8R1P4 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Atg10Q8R1P4 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Atg10Q8R1P4 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atg10Q8R1P4 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Atg10Q8R1P4 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Atg10Q8R1P4 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atg10Q8R1P4 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atg10Q8R1P4 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atg10Q8R1P4 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atg10Q8R1P4 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Atg10Q8R1P4 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Atg10Q8R1P4 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atg10Q8R1P4 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atg10Q8R1P4 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atg10Q8R1P4 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atg10Q8R1P4 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atg10Q8R1P4 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atg10Q8R1P4 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Atg10Q8R1P4 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.5 ms