Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MyripQ8K3I4 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MyripQ8K3I4 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MyripQ8K3I4 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MyripQ8K3I4 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MyripQ8K3I4 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MyripQ8K3I4 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MyripQ8K3I4 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
MyripQ8K3I4 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MyripQ8K3I4 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MyripQ8K3I4 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MyripQ8K3I4 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MyripQ8K3I4 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
MyripQ8K3I4 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
MyripQ8K3I4 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MyripQ8K3I4 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MyripQ8K3I4 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MyripQ8K3I4 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MyripQ8K3I4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MyripQ8K3I4 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MyripQ8K3I4 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MyripQ8K3I4 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MyripQ8K3I4 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MyripQ8K3I4 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MyripQ8K3I4 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MyripQ8K3I4 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MyripQ8K3I4 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MyripQ8K3I4 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MyripQ8K3I4 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MyripQ8K3I4 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MyripQ8K3I4 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
MyripQ8K3I4 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MyripQ8K3I4 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MyripQ8K3I4 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MyripQ8K3I4 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MyripQ8K3I4 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MyripQ8K3I4 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MyripQ8K3I4 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MyripQ8K3I4 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MyripQ8K3I4 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MyripQ8K3I4 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MyripQ8K3I4 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MyripQ8K3I4 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MyripQ8K3I4 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MyripQ8K3I4 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MyripQ8K3I4 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MyripQ8K3I4 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MyripQ8K3I4 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MyripQ8K3I4 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MyripQ8K3I4 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MyripQ8K3I4 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MyripQ8K3I4 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MyripQ8K3I4 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MyripQ8K3I4 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MyripQ8K3I4 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MyripQ8K3I4 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MyripQ8K3I4 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MyripQ8K3I4 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MyripQ8K3I4 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MyripQ8K3I4 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MyripQ8K3I4 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MyripQ8K3I4 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MyripQ8K3I4 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MyripQ8K3I4 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MyripQ8K3I4 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MyripQ8K3I4 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MyripQ8K3I4 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MyripQ8K3I4 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MyripQ8K3I4 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MyripQ8K3I4 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MyripQ8K3I4 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MyripQ8K3I4 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MyripQ8K3I4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MyripQ8K3I4 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
MyripQ8K3I4 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
MyripQ8K3I4 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MyripQ8K3I4 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MyripQ8K3I4 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MyripQ8K3I4 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MyripQ8K3I4 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MyripQ8K3I4 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MyripQ8K3I4 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MyripQ8K3I4 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
MyripQ8K3I4 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
MyripQ8K3I4 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MyripQ8K3I4 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MyripQ8K3I4 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MyripQ8K3I4 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MyripQ8K3I4 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MyripQ8K3I4 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MyripQ8K3I4 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MyripQ8K3I4 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MyripQ8K3I4 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MyripQ8K3I4 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MyripQ8K3I4 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MyripQ8K3I4 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MyripQ8K3I4 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MyripQ8K3I4 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MyripQ8K3I4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MyripQ8K3I4 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms