Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3G5

Vrk3, Inactive serine/threonine-protein kinase VRK3, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vrk3Q8K3G5 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vrk3Q8K3G5 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vrk3Q8K3G5 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vrk3Q8K3G5 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Vrk3Q8K3G5 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Vrk3Q8K3G5 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vrk3Q8K3G5 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Vrk3Q8K3G5 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vrk3Q8K3G5 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vrk3Q8K3G5 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vrk3Q8K3G5 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vrk3Q8K3G5 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vrk3Q8K3G5 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vrk3Q8K3G5 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vrk3Q8K3G5 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vrk3Q8K3G5 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vrk3Q8K3G5 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vrk3Q8K3G5 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vrk3Q8K3G5 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vrk3Q8K3G5 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vrk3Q8K3G5 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vrk3Q8K3G5 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Vrk3Q8K3G5 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vrk3Q8K3G5 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vrk3Q8K3G5 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vrk3Q8K3G5 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vrk3Q8K3G5 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vrk3Q8K3G5 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vrk3Q8K3G5 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vrk3Q8K3G5 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vrk3Q8K3G5 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vrk3Q8K3G5 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vrk3Q8K3G5 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vrk3Q8K3G5 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Vrk3Q8K3G5 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vrk3Q8K3G5 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vrk3Q8K3G5 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vrk3Q8K3G5 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vrk3Q8K3G5 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vrk3Q8K3G5 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vrk3Q8K3G5 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vrk3Q8K3G5 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vrk3Q8K3G5 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vrk3Q8K3G5 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Vrk3Q8K3G5 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vrk3Q8K3G5 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vrk3Q8K3G5 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vrk3Q8K3G5 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vrk3Q8K3G5 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vrk3Q8K3G5 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vrk3Q8K3G5 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vrk3Q8K3G5 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vrk3Q8K3G5 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vrk3Q8K3G5 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Vrk3Q8K3G5 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vrk3Q8K3G5 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vrk3Q8K3G5 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vrk3Q8K3G5 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vrk3Q8K3G5 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vrk3Q8K3G5 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vrk3Q8K3G5 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Vrk3Q8K3G5 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vrk3Q8K3G5 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vrk3Q8K3G5 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vrk3Q8K3G5 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vrk3Q8K3G5 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vrk3Q8K3G5 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vrk3Q8K3G5 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vrk3Q8K3G5 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vrk3Q8K3G5 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vrk3Q8K3G5 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vrk3Q8K3G5 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vrk3Q8K3G5 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vrk3Q8K3G5 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vrk3Q8K3G5 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vrk3Q8K3G5 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vrk3Q8K3G5 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vrk3Q8K3G5 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vrk3Q8K3G5 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vrk3Q8K3G5 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vrk3Q8K3G5 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vrk3Q8K3G5 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vrk3Q8K3G5 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vrk3Q8K3G5 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vrk3Q8K3G5 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vrk3Q8K3G5 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vrk3Q8K3G5 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vrk3Q8K3G5 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vrk3Q8K3G5 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vrk3Q8K3G5 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vrk3Q8K3G5 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vrk3Q8K3G5 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vrk3Q8K3G5 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vrk3Q8K3G5 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vrk3Q8K3G5 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vrk3Q8K3G5 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vrk3Q8K3G5 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vrk3Q8K3G5 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vrk3Q8K3G5 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Vrk3Q8K3G5 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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