Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrtm1Q8K377 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrtm1Q8K377 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrtm1Q8K377 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrtm1Q8K377 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrtm1Q8K377 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrtm1Q8K377 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrtm1Q8K377 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrtm1Q8K377 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrtm1Q8K377 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrtm1Q8K377 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrtm1Q8K377 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrtm1Q8K377 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrtm1Q8K377 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrtm1Q8K377 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrrtm1Q8K377 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrtm1Q8K377 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrtm1Q8K377 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrtm1Q8K377 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrtm1Q8K377 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrtm1Q8K377 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrtm1Q8K377 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrtm1Q8K377 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrtm1Q8K377 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrtm1Q8K377 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrtm1Q8K377 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrtm1Q8K377 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrtm1Q8K377 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrtm1Q8K377 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrtm1Q8K377 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrtm1Q8K377 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrtm1Q8K377 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrtm1Q8K377 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrtm1Q8K377 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrtm1Q8K377 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrtm1Q8K377 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrtm1Q8K377 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrtm1Q8K377 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrrtm1Q8K377 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrtm1Q8K377 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrtm1Q8K377 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrtm1Q8K377 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrtm1Q8K377 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrtm1Q8K377 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrtm1Q8K377 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrtm1Q8K377 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrtm1Q8K377 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrtm1Q8K377 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrtm1Q8K377 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrtm1Q8K377 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrtm1Q8K377 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrtm1Q8K377 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrtm1Q8K377 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrtm1Q8K377 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrtm1Q8K377 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrtm1Q8K377 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrtm1Q8K377 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrtm1Q8K377 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrtm1Q8K377 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrtm1Q8K377 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrtm1Q8K377 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrrtm1Q8K377 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Lrrtm1Q8K377 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Lrrtm1Q8K377 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrtm1Q8K377 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrtm1Q8K377 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrtm1Q8K377 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrtm1Q8K377 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrtm1Q8K377 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrtm1Q8K377 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrtm1Q8K377 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrtm1Q8K377 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrtm1Q8K377 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrtm1Q8K377 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrtm1Q8K377 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrtm1Q8K377 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrrtm1Q8K377 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrtm1Q8K377 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrtm1Q8K377 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrtm1Q8K377 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrtm1Q8K377 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrtm1Q8K377 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrtm1Q8K377 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrtm1Q8K377 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrtm1Q8K377 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrtm1Q8K377 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrtm1Q8K377 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrtm1Q8K377 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrrtm1Q8K377 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrtm1Q8K377 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrtm1Q8K377 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrtm1Q8K377 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrtm1Q8K377 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrtm1Q8K377 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrtm1Q8K377 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrtm1Q8K377 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrtm1Q8K377 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrtm1Q8K377 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrtm1Q8K377 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrtm1Q8K377 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms