Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Prpf39Q8K2Z2 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Prpf39Q8K2Z2 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Prpf39Q8K2Z2 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Prpf39Q8K2Z2 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Prpf39Q8K2Z2 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Prpf39Q8K2Z2 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Prpf39Q8K2Z2 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Prpf39Q8K2Z2 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Prpf39Q8K2Z2 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Prpf39Q8K2Z2 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Prpf39Q8K2Z2 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Prpf39Q8K2Z2 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Prpf39Q8K2Z2 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Prpf39Q8K2Z2 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Prpf39Q8K2Z2 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Prpf39Q8K2Z2 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Prpf39Q8K2Z2 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Prpf39Q8K2Z2 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Prpf39Q8K2Z2 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Prpf39Q8K2Z2 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Prpf39Q8K2Z2 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Prpf39Q8K2Z2 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Prpf39Q8K2Z2 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Prpf39Q8K2Z2 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Prpf39Q8K2Z2 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Prpf39Q8K2Z2 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Prpf39Q8K2Z2 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Prpf39Q8K2Z2 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Prpf39Q8K2Z2 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Prpf39Q8K2Z2 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Prpf39Q8K2Z2 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Prpf39Q8K2Z2 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Prpf39Q8K2Z2 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Prpf39Q8K2Z2 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Prpf39Q8K2Z2 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Prpf39Q8K2Z2 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Prpf39Q8K2Z2 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prpf39Q8K2Z2 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prpf39Q8K2Z2 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prpf39Q8K2Z2 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prpf39Q8K2Z2 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prpf39Q8K2Z2 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prpf39Q8K2Z2 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prpf39Q8K2Z2 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prpf39Q8K2Z2 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prpf39Q8K2Z2 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prpf39Q8K2Z2 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Prpf39Q8K2Z2 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prpf39Q8K2Z2 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prpf39Q8K2Z2 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prpf39Q8K2Z2 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prpf39Q8K2Z2 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prpf39Q8K2Z2 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prpf39Q8K2Z2 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prpf39Q8K2Z2 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prpf39Q8K2Z2 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prpf39Q8K2Z2 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prpf39Q8K2Z2 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prpf39Q8K2Z2 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prpf39Q8K2Z2 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prpf39Q8K2Z2 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prpf39Q8K2Z2 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prpf39Q8K2Z2 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Prpf39Q8K2Z2 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Prpf39Q8K2Z2 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Prpf39Q8K2Z2 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Prpf39Q8K2Z2 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Prpf39Q8K2Z2 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Prpf39Q8K2Z2 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Prpf39Q8K2Z2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prpf39Q8K2Z2 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prpf39Q8K2Z2 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prpf39Q8K2Z2 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prpf39Q8K2Z2 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prpf39Q8K2Z2 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prpf39Q8K2Z2 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prpf39Q8K2Z2 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prpf39Q8K2Z2 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prpf39Q8K2Z2 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Prpf39Q8K2Z2 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Prpf39Q8K2Z2 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Prpf39Q8K2Z2 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Prpf39Q8K2Z2 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Prpf39Q8K2Z2 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Prpf39Q8K2Z2 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Prpf39Q8K2Z2 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Prpf39Q8K2Z2 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Prpf39Q8K2Z2 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Prpf39Q8K2Z2 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Prpf39Q8K2Z2 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Prpf39Q8K2Z2 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Prpf39Q8K2Z2 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Prpf39Q8K2Z2 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Prpf39Q8K2Z2 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Prpf39Q8K2Z2 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Prpf39Q8K2Z2 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Prpf39Q8K2Z2 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Prpf39Q8K2Z2 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Prpf39Q8K2Z2 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms