Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2T8

Paf1, RNA polymerase II-associated factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paf1Q8K2T8 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Paf1Q8K2T8 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Paf1Q8K2T8 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Paf1Q8K2T8 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Paf1Q8K2T8 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Paf1Q8K2T8 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Paf1Q8K2T8 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Paf1Q8K2T8 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Paf1Q8K2T8 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Paf1Q8K2T8 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Paf1Q8K2T8 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Paf1Q8K2T8 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Paf1Q8K2T8 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Paf1Q8K2T8 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Paf1Q8K2T8 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Paf1Q8K2T8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Paf1Q8K2T8 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Paf1Q8K2T8 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Paf1Q8K2T8 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Paf1Q8K2T8 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Paf1Q8K2T8 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Paf1Q8K2T8 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Paf1Q8K2T8 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Paf1Q8K2T8 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Paf1Q8K2T8 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Paf1Q8K2T8 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Paf1Q8K2T8 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Paf1Q8K2T8 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Paf1Q8K2T8 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Paf1Q8K2T8 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Paf1Q8K2T8 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Paf1Q8K2T8 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Paf1Q8K2T8 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Paf1Q8K2T8 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Paf1Q8K2T8 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Paf1Q8K2T8 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Paf1Q8K2T8 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Paf1Q8K2T8 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Paf1Q8K2T8 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Paf1Q8K2T8 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Paf1Q8K2T8 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Paf1Q8K2T8 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Paf1Q8K2T8 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Paf1Q8K2T8 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Paf1Q8K2T8 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Paf1Q8K2T8 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Paf1Q8K2T8 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Paf1Q8K2T8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Paf1Q8K2T8 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Paf1Q8K2T8 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Paf1Q8K2T8 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Paf1Q8K2T8 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Paf1Q8K2T8 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Paf1Q8K2T8 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Paf1Q8K2T8 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Paf1Q8K2T8 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Paf1Q8K2T8 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Paf1Q8K2T8 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Paf1Q8K2T8 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Paf1Q8K2T8 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Paf1Q8K2T8 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Paf1Q8K2T8 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Paf1Q8K2T8 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Paf1Q8K2T8 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Paf1Q8K2T8 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Paf1Q8K2T8 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Paf1Q8K2T8 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Paf1Q8K2T8 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Paf1Q8K2T8 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Paf1Q8K2T8 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Paf1Q8K2T8 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Paf1Q8K2T8 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Paf1Q8K2T8 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Paf1Q8K2T8 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Paf1Q8K2T8 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Paf1Q8K2T8 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Paf1Q8K2T8 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Paf1Q8K2T8 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Paf1Q8K2T8 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Paf1Q8K2T8 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Paf1Q8K2T8 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Paf1Q8K2T8 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Paf1Q8K2T8 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Paf1Q8K2T8 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Paf1Q8K2T8 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Paf1Q8K2T8 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Paf1Q8K2T8 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Paf1Q8K2T8 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Paf1Q8K2T8 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Paf1Q8K2T8 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Paf1Q8K2T8 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Paf1Q8K2T8 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Paf1Q8K2T8 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Paf1Q8K2T8 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Paf1Q8K2T8 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Paf1Q8K2T8 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Paf1Q8K2T8 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Paf1Q8K2T8 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Paf1Q8K2T8 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Paf1Q8K2T8 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms