Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F3

Depp1, Protein DEPP1, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depp1Q8K2F3 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Depp1Q8K2F3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Depp1Q8K2F3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Depp1Q8K2F3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Depp1Q8K2F3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Depp1Q8K2F3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Depp1Q8K2F3 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Depp1Q8K2F3 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Depp1Q8K2F3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Depp1Q8K2F3 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Depp1Q8K2F3 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Depp1Q8K2F3 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Depp1Q8K2F3 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Depp1Q8K2F3 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Depp1Q8K2F3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Depp1Q8K2F3 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Depp1Q8K2F3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Depp1Q8K2F3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Depp1Q8K2F3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Depp1Q8K2F3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Depp1Q8K2F3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Depp1Q8K2F3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Depp1Q8K2F3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Depp1Q8K2F3 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Depp1Q8K2F3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Depp1Q8K2F3 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Depp1Q8K2F3 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Depp1Q8K2F3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Depp1Q8K2F3 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Depp1Q8K2F3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Depp1Q8K2F3 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Depp1Q8K2F3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Depp1Q8K2F3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Depp1Q8K2F3 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Depp1Q8K2F3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Depp1Q8K2F3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Depp1Q8K2F3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Depp1Q8K2F3 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Depp1Q8K2F3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Depp1Q8K2F3 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Depp1Q8K2F3 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Depp1Q8K2F3 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Depp1Q8K2F3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Depp1Q8K2F3 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Depp1Q8K2F3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Depp1Q8K2F3 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Depp1Q8K2F3 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Depp1Q8K2F3 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Depp1Q8K2F3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Depp1Q8K2F3 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Depp1Q8K2F3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Depp1Q8K2F3 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Depp1Q8K2F3 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Depp1Q8K2F3 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Depp1Q8K2F3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Depp1Q8K2F3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Depp1Q8K2F3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Depp1Q8K2F3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Depp1Q8K2F3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Depp1Q8K2F3 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Depp1Q8K2F3 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Depp1Q8K2F3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Depp1Q8K2F3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Depp1Q8K2F3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Depp1Q8K2F3 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Depp1Q8K2F3 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Depp1Q8K2F3 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Depp1Q8K2F3 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Depp1Q8K2F3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Depp1Q8K2F3 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Depp1Q8K2F3 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Depp1Q8K2F3 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Depp1Q8K2F3 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Depp1Q8K2F3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Depp1Q8K2F3 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Depp1Q8K2F3 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Depp1Q8K2F3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Depp1Q8K2F3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Depp1Q8K2F3 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Depp1Q8K2F3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Depp1Q8K2F3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Depp1Q8K2F3 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Depp1Q8K2F3 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Depp1Q8K2F3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Depp1Q8K2F3 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Depp1Q8K2F3 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Depp1Q8K2F3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Depp1Q8K2F3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Depp1Q8K2F3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Depp1Q8K2F3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Depp1Q8K2F3 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Depp1Q8K2F3 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Depp1Q8K2F3 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Depp1Q8K2F3 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Depp1Q8K2F3 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Depp1Q8K2F3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Depp1Q8K2F3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Depp1Q8K2F3 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Depp1Q8K2F3 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Depp1Q8K2F3 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms