Protein–RNA interactions for Protein: Q8K285

Fcho1, F-BAR domain only protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcho1Q8K285 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Fcho1Q8K285 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Fcho1Q8K285 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Fcho1Q8K285 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Fcho1Q8K285 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Fcho1Q8K285 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Fcho1Q8K285 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Fcho1Q8K285 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Fcho1Q8K285 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Fcho1Q8K285 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Fcho1Q8K285 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Fcho1Q8K285 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Fcho1Q8K285 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Fcho1Q8K285 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Fcho1Q8K285 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fcho1Q8K285 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fcho1Q8K285 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fcho1Q8K285 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fcho1Q8K285 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fcho1Q8K285 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fcho1Q8K285 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fcho1Q8K285 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fcho1Q8K285 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fcho1Q8K285 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fcho1Q8K285 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fcho1Q8K285 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fcho1Q8K285 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fcho1Q8K285 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fcho1Q8K285 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fcho1Q8K285 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fcho1Q8K285 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fcho1Q8K285 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fcho1Q8K285 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fcho1Q8K285 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fcho1Q8K285 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fcho1Q8K285 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fcho1Q8K285 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fcho1Q8K285 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Fcho1Q8K285 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fcho1Q8K285 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fcho1Q8K285 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fcho1Q8K285 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fcho1Q8K285 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fcho1Q8K285 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fcho1Q8K285 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fcho1Q8K285 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fcho1Q8K285 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fcho1Q8K285 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fcho1Q8K285 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fcho1Q8K285 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Fcho1Q8K285 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Fcho1Q8K285 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Fcho1Q8K285 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Fcho1Q8K285 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Fcho1Q8K285 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Fcho1Q8K285 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Fcho1Q8K285 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Fcho1Q8K285 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Fcho1Q8K285 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Fcho1Q8K285 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Fcho1Q8K285 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Fcho1Q8K285 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Fcho1Q8K285 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Fcho1Q8K285 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
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Fcho1Q8K285 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Fcho1Q8K285 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Fcho1Q8K285 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
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Fcho1Q8K285 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Fcho1Q8K285 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Fcho1Q8K285 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Fcho1Q8K285 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Fcho1Q8K285 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Fcho1Q8K285 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Fcho1Q8K285 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fcho1Q8K285 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fcho1Q8K285 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fcho1Q8K285 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fcho1Q8K285 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fcho1Q8K285 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fcho1Q8K285 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fcho1Q8K285 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fcho1Q8K285 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fcho1Q8K285 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fcho1Q8K285 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fcho1Q8K285 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fcho1Q8K285 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fcho1Q8K285 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fcho1Q8K285 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fcho1Q8K285 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fcho1Q8K285 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fcho1Q8K285 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fcho1Q8K285 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fcho1Q8K285 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fcho1Q8K285 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fcho1Q8K285 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fcho1Q8K285 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fcho1Q8K285 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms