Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Abcf3Q8K268 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Abcf3Q8K268 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Abcf3Q8K268 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Abcf3Q8K268 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Abcf3Q8K268 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Abcf3Q8K268 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Abcf3Q8K268 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Abcf3Q8K268 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Abcf3Q8K268 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Abcf3Q8K268 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Abcf3Q8K268 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Abcf3Q8K268 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Abcf3Q8K268 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Abcf3Q8K268 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Abcf3Q8K268 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Abcf3Q8K268 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Abcf3Q8K268 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Abcf3Q8K268 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Abcf3Q8K268 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Abcf3Q8K268 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Abcf3Q8K268 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Abcf3Q8K268 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Abcf3Q8K268 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Abcf3Q8K268 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Abcf3Q8K268 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Abcf3Q8K268 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Abcf3Q8K268 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Abcf3Q8K268 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Abcf3Q8K268 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Abcf3Q8K268 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Abcf3Q8K268 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Abcf3Q8K268 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Abcf3Q8K268 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Abcf3Q8K268 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Abcf3Q8K268 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Abcf3Q8K268 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Abcf3Q8K268 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Abcf3Q8K268 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Abcf3Q8K268 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Abcf3Q8K268 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Abcf3Q8K268 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Abcf3Q8K268 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Abcf3Q8K268 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Abcf3Q8K268 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Abcf3Q8K268 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Abcf3Q8K268 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Abcf3Q8K268 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Abcf3Q8K268 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Abcf3Q8K268 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Abcf3Q8K268 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Abcf3Q8K268 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Abcf3Q8K268 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Abcf3Q8K268 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Abcf3Q8K268 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Abcf3Q8K268 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Abcf3Q8K268 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Abcf3Q8K268 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Abcf3Q8K268 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Abcf3Q8K268 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Abcf3Q8K268 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Abcf3Q8K268 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Abcf3Q8K268 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Abcf3Q8K268 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Abcf3Q8K268 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Abcf3Q8K268 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Abcf3Q8K268 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Abcf3Q8K268 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Abcf3Q8K268 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Abcf3Q8K268 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Abcf3Q8K268 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Abcf3Q8K268 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Abcf3Q8K268 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Abcf3Q8K268 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Abcf3Q8K268 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Abcf3Q8K268 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Abcf3Q8K268 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Abcf3Q8K268 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Abcf3Q8K268 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Abcf3Q8K268 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Abcf3Q8K268 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Abcf3Q8K268 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Abcf3Q8K268 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Abcf3Q8K268 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Abcf3Q8K268 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Abcf3Q8K268 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Abcf3Q8K268 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Abcf3Q8K268 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Abcf3Q8K268 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Abcf3Q8K268 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Abcf3Q8K268 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Abcf3Q8K268 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Abcf3Q8K268 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Abcf3Q8K268 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Abcf3Q8K268 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Abcf3Q8K268 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Abcf3Q8K268 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Abcf3Q8K268 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Abcf3Q8K268 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Abcf3Q8K268 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms