Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGF7

Tcerg1, Transcription elongation regulator 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcerg1Q8CGF7 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tcerg1Q8CGF7 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tcerg1Q8CGF7 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tcerg1Q8CGF7 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tcerg1Q8CGF7 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tcerg1Q8CGF7 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tcerg1Q8CGF7 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tcerg1Q8CGF7 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Tcerg1Q8CGF7 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tcerg1Q8CGF7 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tcerg1Q8CGF7 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tcerg1Q8CGF7 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tcerg1Q8CGF7 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tcerg1Q8CGF7 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tcerg1Q8CGF7 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tcerg1Q8CGF7 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tcerg1Q8CGF7 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tcerg1Q8CGF7 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Tcerg1Q8CGF7 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tcerg1Q8CGF7 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tcerg1Q8CGF7 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Tcerg1Q8CGF7 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Tcerg1Q8CGF7 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tcerg1Q8CGF7 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tcerg1Q8CGF7 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tcerg1Q8CGF7 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tcerg1Q8CGF7 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tcerg1Q8CGF7 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tcerg1Q8CGF7 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tcerg1Q8CGF7 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tcerg1Q8CGF7 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tcerg1Q8CGF7 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tcerg1Q8CGF7 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tcerg1Q8CGF7 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tcerg1Q8CGF7 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tcerg1Q8CGF7 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tcerg1Q8CGF7 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tcerg1Q8CGF7 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tcerg1Q8CGF7 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tcerg1Q8CGF7 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tcerg1Q8CGF7 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tcerg1Q8CGF7 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tcerg1Q8CGF7 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Tcerg1Q8CGF7 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tcerg1Q8CGF7 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tcerg1Q8CGF7 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tcerg1Q8CGF7 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tcerg1Q8CGF7 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tcerg1Q8CGF7 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tcerg1Q8CGF7 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Tcerg1Q8CGF7 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tcerg1Q8CGF7 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Tcerg1Q8CGF7 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tcerg1Q8CGF7 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tcerg1Q8CGF7 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tcerg1Q8CGF7 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tcerg1Q8CGF7 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tcerg1Q8CGF7 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tcerg1Q8CGF7 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tcerg1Q8CGF7 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Tcerg1Q8CGF7 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tcerg1Q8CGF7 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tcerg1Q8CGF7 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tcerg1Q8CGF7 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tcerg1Q8CGF7 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tcerg1Q8CGF7 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tcerg1Q8CGF7 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tcerg1Q8CGF7 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tcerg1Q8CGF7 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tcerg1Q8CGF7 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tcerg1Q8CGF7 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tcerg1Q8CGF7 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Tcerg1Q8CGF7 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tcerg1Q8CGF7 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Tcerg1Q8CGF7 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Tcerg1Q8CGF7 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Tcerg1Q8CGF7 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tcerg1Q8CGF7 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tcerg1Q8CGF7 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tcerg1Q8CGF7 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tcerg1Q8CGF7 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Tcerg1Q8CGF7 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tcerg1Q8CGF7 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tcerg1Q8CGF7 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tcerg1Q8CGF7 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tcerg1Q8CGF7 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tcerg1Q8CGF7 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tcerg1Q8CGF7 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tcerg1Q8CGF7 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tcerg1Q8CGF7 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tcerg1Q8CGF7 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tcerg1Q8CGF7 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tcerg1Q8CGF7 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tcerg1Q8CGF7 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tcerg1Q8CGF7 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tcerg1Q8CGF7 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tcerg1Q8CGF7 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tcerg1Q8CGF7 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tcerg1Q8CGF7 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tcerg1Q8CGF7 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms