Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp27Q8CEG8 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp27Q8CEG8 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp27Q8CEG8 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp27Q8CEG8 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp27Q8CEG8 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp27Q8CEG8 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp27Q8CEG8 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp27Q8CEG8 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp27Q8CEG8 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp27Q8CEG8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp27Q8CEG8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp27Q8CEG8 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp27Q8CEG8 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp27Q8CEG8 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp27Q8CEG8 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp27Q8CEG8 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp27Q8CEG8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp27Q8CEG8 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp27Q8CEG8 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Usp27Q8CEG8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Usp27Q8CEG8 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Usp27Q8CEG8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Usp27Q8CEG8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Usp27Q8CEG8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Usp27Q8CEG8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Usp27Q8CEG8 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Usp27Q8CEG8 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Usp27Q8CEG8 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Usp27Q8CEG8 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Usp27Q8CEG8 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Usp27Q8CEG8 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Usp27Q8CEG8 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp27Q8CEG8 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp27Q8CEG8 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp27Q8CEG8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp27Q8CEG8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp27Q8CEG8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp27Q8CEG8 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp27Q8CEG8 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp27Q8CEG8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp27Q8CEG8 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp27Q8CEG8 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp27Q8CEG8 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp27Q8CEG8 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp27Q8CEG8 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp27Q8CEG8 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp27Q8CEG8 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp27Q8CEG8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp27Q8CEG8 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp27Q8CEG8 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp27Q8CEG8 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp27Q8CEG8 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp27Q8CEG8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp27Q8CEG8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp27Q8CEG8 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp27Q8CEG8 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp27Q8CEG8 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp27Q8CEG8 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp27Q8CEG8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp27Q8CEG8 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp27Q8CEG8 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp27Q8CEG8 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp27Q8CEG8 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
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Usp27Q8CEG8 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp27Q8CEG8 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp27Q8CEG8 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp27Q8CEG8 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp27Q8CEG8 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp27Q8CEG8 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp27Q8CEG8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp27Q8CEG8 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp27Q8CEG8 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp27Q8CEG8 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp27Q8CEG8 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp27Q8CEG8 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp27Q8CEG8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp27Q8CEG8 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp27Q8CEG8 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp27Q8CEG8 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp27Q8CEG8 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp27Q8CEG8 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp27Q8CEG8 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp27Q8CEG8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp27Q8CEG8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp27Q8CEG8 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp27Q8CEG8 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp27Q8CEG8 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp27Q8CEG8 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp27Q8CEG8 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp27Q8CEG8 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp27Q8CEG8 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp27Q8CEG8 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp27Q8CEG8 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp27Q8CEG8 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp27Q8CEG8 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp27Q8CEG8 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp27Q8CEG8 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp27Q8CEG8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms