Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBG9

Rnf170, E3 ubiquitin-protein ligase RNF170, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf170Q8CBG9 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Rnf170Q8CBG9 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf170Q8CBG9 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rnf170Q8CBG9 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Rnf170Q8CBG9 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf170Q8CBG9 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Rnf170Q8CBG9 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Rnf170Q8CBG9 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf170Q8CBG9 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Rnf170Q8CBG9 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Rnf170Q8CBG9 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf170Q8CBG9 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Rnf170Q8CBG9 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Rnf170Q8CBG9 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Rnf170Q8CBG9 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf170Q8CBG9 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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