Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXL7

Arfrp1, ADP-ribosylation factor-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfrp1Q8BXL7 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arfrp1Q8BXL7 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arfrp1Q8BXL7 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arfrp1Q8BXL7 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arfrp1Q8BXL7 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arfrp1Q8BXL7 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arfrp1Q8BXL7 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arfrp1Q8BXL7 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arfrp1Q8BXL7 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arfrp1Q8BXL7 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arfrp1Q8BXL7 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arfrp1Q8BXL7 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arfrp1Q8BXL7 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arfrp1Q8BXL7 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arfrp1Q8BXL7 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arfrp1Q8BXL7 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arfrp1Q8BXL7 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arfrp1Q8BXL7 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arfrp1Q8BXL7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arfrp1Q8BXL7 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arfrp1Q8BXL7 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arfrp1Q8BXL7 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arfrp1Q8BXL7 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arfrp1Q8BXL7 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arfrp1Q8BXL7 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arfrp1Q8BXL7 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arfrp1Q8BXL7 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arfrp1Q8BXL7 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arfrp1Q8BXL7 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arfrp1Q8BXL7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arfrp1Q8BXL7 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arfrp1Q8BXL7 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arfrp1Q8BXL7 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arfrp1Q8BXL7 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arfrp1Q8BXL7 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arfrp1Q8BXL7 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Arfrp1Q8BXL7 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arfrp1Q8BXL7 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arfrp1Q8BXL7 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arfrp1Q8BXL7 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arfrp1Q8BXL7 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arfrp1Q8BXL7 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arfrp1Q8BXL7 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arfrp1Q8BXL7 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arfrp1Q8BXL7 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Arfrp1Q8BXL7 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Arfrp1Q8BXL7 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arfrp1Q8BXL7 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arfrp1Q8BXL7 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arfrp1Q8BXL7 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arfrp1Q8BXL7 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arfrp1Q8BXL7 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Arfrp1Q8BXL7 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arfrp1Q8BXL7 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arfrp1Q8BXL7 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arfrp1Q8BXL7 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arfrp1Q8BXL7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arfrp1Q8BXL7 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arfrp1Q8BXL7 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Arfrp1Q8BXL7 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arfrp1Q8BXL7 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arfrp1Q8BXL7 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arfrp1Q8BXL7 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arfrp1Q8BXL7 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arfrp1Q8BXL7 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arfrp1Q8BXL7 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arfrp1Q8BXL7 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arfrp1Q8BXL7 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arfrp1Q8BXL7 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Arfrp1Q8BXL7 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arfrp1Q8BXL7 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arfrp1Q8BXL7 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arfrp1Q8BXL7 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arfrp1Q8BXL7 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arfrp1Q8BXL7 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arfrp1Q8BXL7 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arfrp1Q8BXL7 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arfrp1Q8BXL7 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arfrp1Q8BXL7 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arfrp1Q8BXL7 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arfrp1Q8BXL7 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arfrp1Q8BXL7 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Arfrp1Q8BXL7 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arfrp1Q8BXL7 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arfrp1Q8BXL7 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arfrp1Q8BXL7 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arfrp1Q8BXL7 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arfrp1Q8BXL7 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Arfrp1Q8BXL7 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Arfrp1Q8BXL7 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arfrp1Q8BXL7 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arfrp1Q8BXL7 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arfrp1Q8BXL7 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arfrp1Q8BXL7 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arfrp1Q8BXL7 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arfrp1Q8BXL7 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arfrp1Q8BXL7 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arfrp1Q8BXL7 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arfrp1Q8BXL7 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Arfrp1Q8BXL7 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms