Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXA6

Cldn17, Claudin-17, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn17Q8BXA6 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn17Q8BXA6 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn17Q8BXA6 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn17Q8BXA6 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn17Q8BXA6 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn17Q8BXA6 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldn17Q8BXA6 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldn17Q8BXA6 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldn17Q8BXA6 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldn17Q8BXA6 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldn17Q8BXA6 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldn17Q8BXA6 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldn17Q8BXA6 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldn17Q8BXA6 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldn17Q8BXA6 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldn17Q8BXA6 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldn17Q8BXA6 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldn17Q8BXA6 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cldn17Q8BXA6 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cldn17Q8BXA6 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cldn17Q8BXA6 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn17Q8BXA6 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn17Q8BXA6 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn17Q8BXA6 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn17Q8BXA6 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn17Q8BXA6 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn17Q8BXA6 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn17Q8BXA6 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn17Q8BXA6 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn17Q8BXA6 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn17Q8BXA6 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn17Q8BXA6 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn17Q8BXA6 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn17Q8BXA6 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn17Q8BXA6 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn17Q8BXA6 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn17Q8BXA6 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn17Q8BXA6 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn17Q8BXA6 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn17Q8BXA6 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn17Q8BXA6 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn17Q8BXA6 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn17Q8BXA6 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn17Q8BXA6 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn17Q8BXA6 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn17Q8BXA6 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn17Q8BXA6 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn17Q8BXA6 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn17Q8BXA6 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn17Q8BXA6 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn17Q8BXA6 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn17Q8BXA6 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn17Q8BXA6 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn17Q8BXA6 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn17Q8BXA6 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn17Q8BXA6 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn17Q8BXA6 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn17Q8BXA6 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn17Q8BXA6 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn17Q8BXA6 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn17Q8BXA6 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn17Q8BXA6 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn17Q8BXA6 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cldn17Q8BXA6 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn17Q8BXA6 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn17Q8BXA6 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn17Q8BXA6 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn17Q8BXA6 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn17Q8BXA6 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn17Q8BXA6 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn17Q8BXA6 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn17Q8BXA6 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn17Q8BXA6 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn17Q8BXA6 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn17Q8BXA6 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn17Q8BXA6 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn17Q8BXA6 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn17Q8BXA6 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn17Q8BXA6 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn17Q8BXA6 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn17Q8BXA6 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn17Q8BXA6 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn17Q8BXA6 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn17Q8BXA6 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn17Q8BXA6 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cldn17Q8BXA6 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn17Q8BXA6 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn17Q8BXA6 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn17Q8BXA6 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn17Q8BXA6 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn17Q8BXA6 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn17Q8BXA6 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn17Q8BXA6 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn17Q8BXA6 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cldn17Q8BXA6 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cldn17Q8BXA6 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cldn17Q8BXA6 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cldn17Q8BXA6 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cldn17Q8BXA6 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cldn17Q8BXA6 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
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