Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVA4

Lmod1, Leiomodin-1, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod1Q8BVA4 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lmod1Q8BVA4 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lmod1Q8BVA4 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Lmod1Q8BVA4 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lmod1Q8BVA4 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lmod1Q8BVA4 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lmod1Q8BVA4 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lmod1Q8BVA4 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Lmod1Q8BVA4 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lmod1Q8BVA4 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lmod1Q8BVA4 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lmod1Q8BVA4 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lmod1Q8BVA4 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lmod1Q8BVA4 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lmod1Q8BVA4 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lmod1Q8BVA4 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lmod1Q8BVA4 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lmod1Q8BVA4 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lmod1Q8BVA4 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lmod1Q8BVA4 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lmod1Q8BVA4 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lmod1Q8BVA4 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lmod1Q8BVA4 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lmod1Q8BVA4 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Lmod1Q8BVA4 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lmod1Q8BVA4 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lmod1Q8BVA4 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lmod1Q8BVA4 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lmod1Q8BVA4 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lmod1Q8BVA4 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lmod1Q8BVA4 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lmod1Q8BVA4 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lmod1Q8BVA4 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lmod1Q8BVA4 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lmod1Q8BVA4 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lmod1Q8BVA4 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lmod1Q8BVA4 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lmod1Q8BVA4 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lmod1Q8BVA4 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lmod1Q8BVA4 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lmod1Q8BVA4 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lmod1Q8BVA4 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lmod1Q8BVA4 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Lmod1Q8BVA4 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lmod1Q8BVA4 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lmod1Q8BVA4 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lmod1Q8BVA4 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lmod1Q8BVA4 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lmod1Q8BVA4 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lmod1Q8BVA4 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lmod1Q8BVA4 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lmod1Q8BVA4 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lmod1Q8BVA4 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lmod1Q8BVA4 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lmod1Q8BVA4 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lmod1Q8BVA4 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lmod1Q8BVA4 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Lmod1Q8BVA4 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lmod1Q8BVA4 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lmod1Q8BVA4 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lmod1Q8BVA4 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lmod1Q8BVA4 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lmod1Q8BVA4 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lmod1Q8BVA4 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lmod1Q8BVA4 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lmod1Q8BVA4 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lmod1Q8BVA4 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lmod1Q8BVA4 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lmod1Q8BVA4 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lmod1Q8BVA4 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lmod1Q8BVA4 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Lmod1Q8BVA4 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lmod1Q8BVA4 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lmod1Q8BVA4 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lmod1Q8BVA4 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lmod1Q8BVA4 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lmod1Q8BVA4 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lmod1Q8BVA4 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lmod1Q8BVA4 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lmod1Q8BVA4 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lmod1Q8BVA4 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lmod1Q8BVA4 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lmod1Q8BVA4 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lmod1Q8BVA4 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Lmod1Q8BVA4 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lmod1Q8BVA4 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lmod1Q8BVA4 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lmod1Q8BVA4 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lmod1Q8BVA4 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lmod1Q8BVA4 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lmod1Q8BVA4 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lmod1Q8BVA4 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lmod1Q8BVA4 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lmod1Q8BVA4 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lmod1Q8BVA4 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lmod1Q8BVA4 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lmod1Q8BVA4 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lmod1Q8BVA4 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lmod1Q8BVA4 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lmod1Q8BVA4 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms